Protein–RNA interactions for Protein: C9JE40

PATL2, Protein PAT1 homolog 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PATL2C9JE40 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PATL2C9JE40 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PATL2C9JE40 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PATL2C9JE40 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PATL2C9JE40 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PATL2C9JE40 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PATL2C9JE40 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PATL2C9JE40 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PATL2C9JE40 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PATL2C9JE40 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PATL2C9JE40 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PATL2C9JE40 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PATL2C9JE40 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PATL2C9JE40 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
PATL2C9JE40 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PATL2C9JE40 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PATL2C9JE40 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PATL2C9JE40 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PATL2C9JE40 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
PATL2C9JE40 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
PATL2C9JE40 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PATL2C9JE40 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PATL2C9JE40 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PATL2C9JE40 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PATL2C9JE40 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PATL2C9JE40 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PATL2C9JE40 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PATL2C9JE40 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PATL2C9JE40 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PATL2C9JE40 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PATL2C9JE40 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PATL2C9JE40 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PATL2C9JE40 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
PATL2C9JE40 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PATL2C9JE40 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PATL2C9JE40 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PATL2C9JE40 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PATL2C9JE40 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PATL2C9JE40 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PATL2C9JE40 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PATL2C9JE40 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PATL2C9JE40 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
PATL2C9JE40 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PATL2C9JE40 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PATL2C9JE40 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PATL2C9JE40 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PATL2C9JE40 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PATL2C9JE40 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PATL2C9JE40 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PATL2C9JE40 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PATL2C9JE40 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PATL2C9JE40 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PATL2C9JE40 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PATL2C9JE40 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PATL2C9JE40 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
PATL2C9JE40 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
PATL2C9JE40 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
PATL2C9JE40 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
PATL2C9JE40 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PATL2C9JE40 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PATL2C9JE40 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
PATL2C9JE40 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PATL2C9JE40 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PATL2C9JE40 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PATL2C9JE40 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PATL2C9JE40 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PATL2C9JE40 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PATL2C9JE40 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PATL2C9JE40 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PATL2C9JE40 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PATL2C9JE40 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
PATL2C9JE40 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PATL2C9JE40 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PATL2C9JE40 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PATL2C9JE40 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PATL2C9JE40 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PATL2C9JE40 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PATL2C9JE40 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PATL2C9JE40 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PATL2C9JE40 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PATL2C9JE40 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PATL2C9JE40 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PATL2C9JE40 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PATL2C9JE40 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PATL2C9JE40 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PATL2C9JE40 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PATL2C9JE40 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PATL2C9JE40 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
PATL2C9JE40 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
PATL2C9JE40 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PATL2C9JE40 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PATL2C9JE40 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PATL2C9JE40 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PATL2C9JE40 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PATL2C9JE40 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PATL2C9JE40 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PATL2C9JE40 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PATL2C9JE40 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PATL2C9JE40 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PATL2C9JE40 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms