Protein–RNA interactions for Protein: A8MV65

VGLL3, Transcription cofactor vestigial-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VGLL3A8MV65 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
VGLL3A8MV65 CDT1-201ENST00000301019 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
VGLL3A8MV65 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
VGLL3A8MV65 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
VGLL3A8MV65 FERMT3-201ENST00000279227 2489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
VGLL3A8MV65 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
VGLL3A8MV65 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
VGLL3A8MV65 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
VGLL3A8MV65 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
VGLL3A8MV65 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
VGLL3A8MV65 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
VGLL3A8MV65 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
VGLL3A8MV65 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
VGLL3A8MV65 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
VGLL3A8MV65 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
VGLL3A8MV65 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
VGLL3A8MV65 NFATC1-218ENST00000592223 2531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
VGLL3A8MV65 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
VGLL3A8MV65 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
VGLL3A8MV65 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
VGLL3A8MV65 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
VGLL3A8MV65 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
VGLL3A8MV65 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
VGLL3A8MV65 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
VGLL3A8MV65 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
VGLL3A8MV65 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
VGLL3A8MV65 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
VGLL3A8MV65 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
VGLL3A8MV65 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
VGLL3A8MV65 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
VGLL3A8MV65 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
VGLL3A8MV65 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
VGLL3A8MV65 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
VGLL3A8MV65 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
VGLL3A8MV65 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
VGLL3A8MV65 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
VGLL3A8MV65 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
VGLL3A8MV65 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
VGLL3A8MV65 NYAP1-201ENST00000300179 3581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
VGLL3A8MV65 AC015656.1-201ENST00000624209 3578 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
VGLL3A8MV65 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
VGLL3A8MV65 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
VGLL3A8MV65 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
VGLL3A8MV65 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
VGLL3A8MV65 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
VGLL3A8MV65 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
VGLL3A8MV65 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
VGLL3A8MV65 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
VGLL3A8MV65 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
VGLL3A8MV65 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
VGLL3A8MV65 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
VGLL3A8MV65 TMEM38A-201ENST00000187762 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
VGLL3A8MV65 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
VGLL3A8MV65 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
VGLL3A8MV65 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
VGLL3A8MV65 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
VGLL3A8MV65 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
VGLL3A8MV65 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
VGLL3A8MV65 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
VGLL3A8MV65 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
VGLL3A8MV65 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
VGLL3A8MV65 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
VGLL3A8MV65 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
VGLL3A8MV65 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
VGLL3A8MV65 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
VGLL3A8MV65 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
VGLL3A8MV65 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
VGLL3A8MV65 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
VGLL3A8MV65 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
VGLL3A8MV65 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
VGLL3A8MV65 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
VGLL3A8MV65 PSD-209ENST00000611678 3382 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
VGLL3A8MV65 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
VGLL3A8MV65 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
VGLL3A8MV65 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
VGLL3A8MV65 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
VGLL3A8MV65 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
VGLL3A8MV65 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
VGLL3A8MV65 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
VGLL3A8MV65 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
VGLL3A8MV65 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
VGLL3A8MV65 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
VGLL3A8MV65 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
VGLL3A8MV65 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
VGLL3A8MV65 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
VGLL3A8MV65 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
VGLL3A8MV65 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
VGLL3A8MV65 RUFY1-202ENST00000393438 2454 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
VGLL3A8MV65 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
VGLL3A8MV65 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
VGLL3A8MV65 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
VGLL3A8MV65 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
VGLL3A8MV65 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
VGLL3A8MV65 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
VGLL3A8MV65 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
VGLL3A8MV65 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
VGLL3A8MV65 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
VGLL3A8MV65 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
VGLL3A8MV65 GPAT2-202ENST00000434632 3061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
VGLL3A8MV65 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms