Protein–RNA interactions for Protein: A6NEF3

GOLGA6L4, Golgin subfamily A member 6-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA6L4A6NEF3 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GOLGA6L4A6NEF3 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GOLGA6L4A6NEF3 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GOLGA6L4A6NEF3 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GOLGA6L4A6NEF3 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GOLGA6L4A6NEF3 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GOLGA6L4A6NEF3 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GOLGA6L4A6NEF3 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GOLGA6L4A6NEF3 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GOLGA6L4A6NEF3 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GOLGA6L4A6NEF3 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GOLGA6L4A6NEF3 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GOLGA6L4A6NEF3 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GOLGA6L4A6NEF3 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GOLGA6L4A6NEF3 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GOLGA6L4A6NEF3 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GOLGA6L4A6NEF3 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GOLGA6L4A6NEF3 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GOLGA6L4A6NEF3 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GOLGA6L4A6NEF3 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GOLGA6L4A6NEF3 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
GOLGA6L4A6NEF3 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
GOLGA6L4A6NEF3 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
GOLGA6L4A6NEF3 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GOLGA6L4A6NEF3 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GOLGA6L4A6NEF3 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GOLGA6L4A6NEF3 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GOLGA6L4A6NEF3 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GOLGA6L4A6NEF3 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GOLGA6L4A6NEF3 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GOLGA6L4A6NEF3 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GOLGA6L4A6NEF3 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GOLGA6L4A6NEF3 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GOLGA6L4A6NEF3 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GOLGA6L4A6NEF3 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GOLGA6L4A6NEF3 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GOLGA6L4A6NEF3 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GOLGA6L4A6NEF3 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GOLGA6L4A6NEF3 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GOLGA6L4A6NEF3 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GOLGA6L4A6NEF3 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GOLGA6L4A6NEF3 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GOLGA6L4A6NEF3 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GOLGA6L4A6NEF3 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GOLGA6L4A6NEF3 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GOLGA6L4A6NEF3 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GOLGA6L4A6NEF3 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GOLGA6L4A6NEF3 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GOLGA6L4A6NEF3 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
GOLGA6L4A6NEF3 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GOLGA6L4A6NEF3 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GOLGA6L4A6NEF3 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GOLGA6L4A6NEF3 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GOLGA6L4A6NEF3 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GOLGA6L4A6NEF3 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GOLGA6L4A6NEF3 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GOLGA6L4A6NEF3 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GOLGA6L4A6NEF3 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GOLGA6L4A6NEF3 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GOLGA6L4A6NEF3 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GOLGA6L4A6NEF3 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GOLGA6L4A6NEF3 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GOLGA6L4A6NEF3 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GOLGA6L4A6NEF3 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GOLGA6L4A6NEF3 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GOLGA6L4A6NEF3 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GOLGA6L4A6NEF3 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GOLGA6L4A6NEF3 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GOLGA6L4A6NEF3 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GOLGA6L4A6NEF3 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GOLGA6L4A6NEF3 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GOLGA6L4A6NEF3 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GOLGA6L4A6NEF3 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GOLGA6L4A6NEF3 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GOLGA6L4A6NEF3 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GOLGA6L4A6NEF3 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GOLGA6L4A6NEF3 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GOLGA6L4A6NEF3 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GOLGA6L4A6NEF3 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GOLGA6L4A6NEF3 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GOLGA6L4A6NEF3 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GOLGA6L4A6NEF3 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GOLGA6L4A6NEF3 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GOLGA6L4A6NEF3 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GOLGA6L4A6NEF3 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GOLGA6L4A6NEF3 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GOLGA6L4A6NEF3 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GOLGA6L4A6NEF3 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GOLGA6L4A6NEF3 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GOLGA6L4A6NEF3 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GOLGA6L4A6NEF3 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GOLGA6L4A6NEF3 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GOLGA6L4A6NEF3 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GOLGA6L4A6NEF3 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GOLGA6L4A6NEF3 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GOLGA6L4A6NEF3 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GOLGA6L4A6NEF3 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GOLGA6L4A6NEF3 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
GOLGA6L4A6NEF3 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GOLGA6L4A6NEF3 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms