Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPZ6

THSD7A, Thrombospondin type-1 domain-containing protein 7A, humanhuman

Predictions only

Length 1,657 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THSD7AQ9UPZ6 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
THSD7AQ9UPZ6 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
THSD7AQ9UPZ6 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
THSD7AQ9UPZ6 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
THSD7AQ9UPZ6 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
THSD7AQ9UPZ6 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
THSD7AQ9UPZ6 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
THSD7AQ9UPZ6 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
THSD7AQ9UPZ6 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
THSD7AQ9UPZ6 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
THSD7AQ9UPZ6 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
THSD7AQ9UPZ6 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
THSD7AQ9UPZ6 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
THSD7AQ9UPZ6 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
THSD7AQ9UPZ6 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
THSD7AQ9UPZ6 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
THSD7AQ9UPZ6 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
THSD7AQ9UPZ6 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
THSD7AQ9UPZ6 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
THSD7AQ9UPZ6 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
THSD7AQ9UPZ6 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
THSD7AQ9UPZ6 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
THSD7AQ9UPZ6 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
THSD7AQ9UPZ6 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
THSD7AQ9UPZ6 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
THSD7AQ9UPZ6 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
THSD7AQ9UPZ6 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
THSD7AQ9UPZ6 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
THSD7AQ9UPZ6 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
THSD7AQ9UPZ6 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
THSD7AQ9UPZ6 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
THSD7AQ9UPZ6 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
THSD7AQ9UPZ6 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
THSD7AQ9UPZ6 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
THSD7AQ9UPZ6 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
THSD7AQ9UPZ6 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
THSD7AQ9UPZ6 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
THSD7AQ9UPZ6 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
THSD7AQ9UPZ6 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
THSD7AQ9UPZ6 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
THSD7AQ9UPZ6 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC24.15■■□□□ 1.46
THSD7AQ9UPZ6 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
THSD7AQ9UPZ6 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
THSD7AQ9UPZ6 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
THSD7AQ9UPZ6 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
THSD7AQ9UPZ6 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
THSD7AQ9UPZ6 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
THSD7AQ9UPZ6 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
THSD7AQ9UPZ6 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
THSD7AQ9UPZ6 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
THSD7AQ9UPZ6 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
THSD7AQ9UPZ6 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
THSD7AQ9UPZ6 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
THSD7AQ9UPZ6 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
THSD7AQ9UPZ6 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
THSD7AQ9UPZ6 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
THSD7AQ9UPZ6 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
THSD7AQ9UPZ6 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
THSD7AQ9UPZ6 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
THSD7AQ9UPZ6 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
THSD7AQ9UPZ6 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
THSD7AQ9UPZ6 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
THSD7AQ9UPZ6 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
THSD7AQ9UPZ6 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
THSD7AQ9UPZ6 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
THSD7AQ9UPZ6 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
THSD7AQ9UPZ6 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
THSD7AQ9UPZ6 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
THSD7AQ9UPZ6 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
THSD7AQ9UPZ6 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
THSD7AQ9UPZ6 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
THSD7AQ9UPZ6 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
THSD7AQ9UPZ6 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
THSD7AQ9UPZ6 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
THSD7AQ9UPZ6 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
THSD7AQ9UPZ6 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
THSD7AQ9UPZ6 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
THSD7AQ9UPZ6 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
THSD7AQ9UPZ6 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
THSD7AQ9UPZ6 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
THSD7AQ9UPZ6 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
THSD7AQ9UPZ6 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
THSD7AQ9UPZ6 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
THSD7AQ9UPZ6 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
THSD7AQ9UPZ6 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
THSD7AQ9UPZ6 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
THSD7AQ9UPZ6 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
THSD7AQ9UPZ6 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
THSD7AQ9UPZ6 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
THSD7AQ9UPZ6 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
THSD7AQ9UPZ6 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
THSD7AQ9UPZ6 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
THSD7AQ9UPZ6 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
THSD7AQ9UPZ6 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
THSD7AQ9UPZ6 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
THSD7AQ9UPZ6 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
THSD7AQ9UPZ6 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
THSD7AQ9UPZ6 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
THSD7AQ9UPZ6 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
THSD7AQ9UPZ6 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms