Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2N7

KLHL13, Kelch-like protein 13, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL13Q9P2N7 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
KLHL13Q9P2N7 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
KLHL13Q9P2N7 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
KLHL13Q9P2N7 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
KLHL13Q9P2N7 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
KLHL13Q9P2N7 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
KLHL13Q9P2N7 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
KLHL13Q9P2N7 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
KLHL13Q9P2N7 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
KLHL13Q9P2N7 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
KLHL13Q9P2N7 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
KLHL13Q9P2N7 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
KLHL13Q9P2N7 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
KLHL13Q9P2N7 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
KLHL13Q9P2N7 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
KLHL13Q9P2N7 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
KLHL13Q9P2N7 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
KLHL13Q9P2N7 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
KLHL13Q9P2N7 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
KLHL13Q9P2N7 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
KLHL13Q9P2N7 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
KLHL13Q9P2N7 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
KLHL13Q9P2N7 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
KLHL13Q9P2N7 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
KLHL13Q9P2N7 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
KLHL13Q9P2N7 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
KLHL13Q9P2N7 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
KLHL13Q9P2N7 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
KLHL13Q9P2N7 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
KLHL13Q9P2N7 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
KLHL13Q9P2N7 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
KLHL13Q9P2N7 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
KLHL13Q9P2N7 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
KLHL13Q9P2N7 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
KLHL13Q9P2N7 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
KLHL13Q9P2N7 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
KLHL13Q9P2N7 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
KLHL13Q9P2N7 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
KLHL13Q9P2N7 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
KLHL13Q9P2N7 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
KLHL13Q9P2N7 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
KLHL13Q9P2N7 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
KLHL13Q9P2N7 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
KLHL13Q9P2N7 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
KLHL13Q9P2N7 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.81■□□□□ 0.28
KLHL13Q9P2N7 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
KLHL13Q9P2N7 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
KLHL13Q9P2N7 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
KLHL13Q9P2N7 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
KLHL13Q9P2N7 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
KLHL13Q9P2N7 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
KLHL13Q9P2N7 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
KLHL13Q9P2N7 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
KLHL13Q9P2N7 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
KLHL13Q9P2N7 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
KLHL13Q9P2N7 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
KLHL13Q9P2N7 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.81■□□□□ 0.28
KLHL13Q9P2N7 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
KLHL13Q9P2N7 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
KLHL13Q9P2N7 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
KLHL13Q9P2N7 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
KLHL13Q9P2N7 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
KLHL13Q9P2N7 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
KLHL13Q9P2N7 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
KLHL13Q9P2N7 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
KLHL13Q9P2N7 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
KLHL13Q9P2N7 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
KLHL13Q9P2N7 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
KLHL13Q9P2N7 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
KLHL13Q9P2N7 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
KLHL13Q9P2N7 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
KLHL13Q9P2N7 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
KLHL13Q9P2N7 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
KLHL13Q9P2N7 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
KLHL13Q9P2N7 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
KLHL13Q9P2N7 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
KLHL13Q9P2N7 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
KLHL13Q9P2N7 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
KLHL13Q9P2N7 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
KLHL13Q9P2N7 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
KLHL13Q9P2N7 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
KLHL13Q9P2N7 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
KLHL13Q9P2N7 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
KLHL13Q9P2N7 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
KLHL13Q9P2N7 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
KLHL13Q9P2N7 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
KLHL13Q9P2N7 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
KLHL13Q9P2N7 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
KLHL13Q9P2N7 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
KLHL13Q9P2N7 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
KLHL13Q9P2N7 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
KLHL13Q9P2N7 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
KLHL13Q9P2N7 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
KLHL13Q9P2N7 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
KLHL13Q9P2N7 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
KLHL13Q9P2N7 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
KLHL13Q9P2N7 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
KLHL13Q9P2N7 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
KLHL13Q9P2N7 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
KLHL13Q9P2N7 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms