Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2J3

KLHL9, Kelch-like protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 617 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL9Q9P2J3 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
KLHL9Q9P2J3 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
KLHL9Q9P2J3 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
KLHL9Q9P2J3 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
KLHL9Q9P2J3 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
KLHL9Q9P2J3 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
KLHL9Q9P2J3 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
KLHL9Q9P2J3 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
KLHL9Q9P2J3 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
KLHL9Q9P2J3 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
KLHL9Q9P2J3 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
KLHL9Q9P2J3 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
KLHL9Q9P2J3 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
KLHL9Q9P2J3 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
KLHL9Q9P2J3 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
KLHL9Q9P2J3 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
KLHL9Q9P2J3 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
KLHL9Q9P2J3 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
KLHL9Q9P2J3 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
KLHL9Q9P2J3 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
KLHL9Q9P2J3 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
KLHL9Q9P2J3 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
KLHL9Q9P2J3 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
KLHL9Q9P2J3 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
KLHL9Q9P2J3 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
KLHL9Q9P2J3 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
KLHL9Q9P2J3 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
KLHL9Q9P2J3 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
KLHL9Q9P2J3 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
KLHL9Q9P2J3 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
KLHL9Q9P2J3 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
KLHL9Q9P2J3 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
KLHL9Q9P2J3 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
KLHL9Q9P2J3 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
KLHL9Q9P2J3 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
KLHL9Q9P2J3 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
KLHL9Q9P2J3 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC16.96■□□□□ 0.3
KLHL9Q9P2J3 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
KLHL9Q9P2J3 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
KLHL9Q9P2J3 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
KLHL9Q9P2J3 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
KLHL9Q9P2J3 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
KLHL9Q9P2J3 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
KLHL9Q9P2J3 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
KLHL9Q9P2J3 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
KLHL9Q9P2J3 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC16.96■□□□□ 0.3
KLHL9Q9P2J3 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
KLHL9Q9P2J3 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
KLHL9Q9P2J3 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
KLHL9Q9P2J3 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC16.96■□□□□ 0.3
KLHL9Q9P2J3 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
KLHL9Q9P2J3 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
KLHL9Q9P2J3 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
KLHL9Q9P2J3 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
KLHL9Q9P2J3 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
KLHL9Q9P2J3 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
KLHL9Q9P2J3 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
KLHL9Q9P2J3 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
KLHL9Q9P2J3 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
KLHL9Q9P2J3 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
KLHL9Q9P2J3 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
KLHL9Q9P2J3 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
KLHL9Q9P2J3 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
KLHL9Q9P2J3 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
KLHL9Q9P2J3 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
KLHL9Q9P2J3 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
KLHL9Q9P2J3 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
KLHL9Q9P2J3 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
KLHL9Q9P2J3 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
KLHL9Q9P2J3 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
KLHL9Q9P2J3 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
KLHL9Q9P2J3 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
KLHL9Q9P2J3 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
KLHL9Q9P2J3 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
KLHL9Q9P2J3 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
KLHL9Q9P2J3 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
KLHL9Q9P2J3 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
KLHL9Q9P2J3 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
KLHL9Q9P2J3 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
KLHL9Q9P2J3 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
KLHL9Q9P2J3 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
KLHL9Q9P2J3 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
KLHL9Q9P2J3 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
KLHL9Q9P2J3 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
KLHL9Q9P2J3 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
KLHL9Q9P2J3 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
KLHL9Q9P2J3 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
KLHL9Q9P2J3 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
KLHL9Q9P2J3 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
KLHL9Q9P2J3 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
KLHL9Q9P2J3 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
KLHL9Q9P2J3 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
KLHL9Q9P2J3 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
KLHL9Q9P2J3 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
KLHL9Q9P2J3 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
KLHL9Q9P2J3 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
KLHL9Q9P2J3 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
KLHL9Q9P2J3 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
KLHL9Q9P2J3 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
KLHL9Q9P2J3 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.3 ms