Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPH3

IL1RAP, Interleukin-1 receptor accessory protein, humanhuman

Predictions only

Length 570 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IL1RAPQ9NPH3 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
IL1RAPQ9NPH3 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
IL1RAPQ9NPH3 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
IL1RAPQ9NPH3 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
IL1RAPQ9NPH3 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
IL1RAPQ9NPH3 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
IL1RAPQ9NPH3 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
IL1RAPQ9NPH3 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
IL1RAPQ9NPH3 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
IL1RAPQ9NPH3 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
IL1RAPQ9NPH3 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
IL1RAPQ9NPH3 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
IL1RAPQ9NPH3 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
IL1RAPQ9NPH3 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
IL1RAPQ9NPH3 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
IL1RAPQ9NPH3 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
IL1RAPQ9NPH3 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
IL1RAPQ9NPH3 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
IL1RAPQ9NPH3 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
IL1RAPQ9NPH3 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
IL1RAPQ9NPH3 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
IL1RAPQ9NPH3 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
IL1RAPQ9NPH3 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
IL1RAPQ9NPH3 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
IL1RAPQ9NPH3 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
IL1RAPQ9NPH3 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
IL1RAPQ9NPH3 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
IL1RAPQ9NPH3 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
IL1RAPQ9NPH3 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
IL1RAPQ9NPH3 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
IL1RAPQ9NPH3 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
IL1RAPQ9NPH3 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
IL1RAPQ9NPH3 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
IL1RAPQ9NPH3 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
IL1RAPQ9NPH3 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
IL1RAPQ9NPH3 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
IL1RAPQ9NPH3 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
IL1RAPQ9NPH3 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
IL1RAPQ9NPH3 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
IL1RAPQ9NPH3 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
IL1RAPQ9NPH3 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
IL1RAPQ9NPH3 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
IL1RAPQ9NPH3 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
IL1RAPQ9NPH3 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
IL1RAPQ9NPH3 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
IL1RAPQ9NPH3 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
IL1RAPQ9NPH3 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
IL1RAPQ9NPH3 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
IL1RAPQ9NPH3 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
IL1RAPQ9NPH3 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
IL1RAPQ9NPH3 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
IL1RAPQ9NPH3 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
IL1RAPQ9NPH3 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
IL1RAPQ9NPH3 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
IL1RAPQ9NPH3 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
IL1RAPQ9NPH3 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
IL1RAPQ9NPH3 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
IL1RAPQ9NPH3 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
IL1RAPQ9NPH3 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
IL1RAPQ9NPH3 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
IL1RAPQ9NPH3 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
IL1RAPQ9NPH3 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
IL1RAPQ9NPH3 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
IL1RAPQ9NPH3 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
IL1RAPQ9NPH3 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
IL1RAPQ9NPH3 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
IL1RAPQ9NPH3 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
IL1RAPQ9NPH3 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
IL1RAPQ9NPH3 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
IL1RAPQ9NPH3 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
IL1RAPQ9NPH3 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
IL1RAPQ9NPH3 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
IL1RAPQ9NPH3 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
IL1RAPQ9NPH3 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
IL1RAPQ9NPH3 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
IL1RAPQ9NPH3 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
IL1RAPQ9NPH3 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
IL1RAPQ9NPH3 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
IL1RAPQ9NPH3 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
IL1RAPQ9NPH3 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
IL1RAPQ9NPH3 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
IL1RAPQ9NPH3 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
IL1RAPQ9NPH3 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
IL1RAPQ9NPH3 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
IL1RAPQ9NPH3 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
IL1RAPQ9NPH3 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
IL1RAPQ9NPH3 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
IL1RAPQ9NPH3 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
IL1RAPQ9NPH3 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
IL1RAPQ9NPH3 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
IL1RAPQ9NPH3 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
IL1RAPQ9NPH3 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
IL1RAPQ9NPH3 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
IL1RAPQ9NPH3 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
IL1RAPQ9NPH3 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
IL1RAPQ9NPH3 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
IL1RAPQ9NPH3 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
IL1RAPQ9NPH3 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
IL1RAPQ9NPH3 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
IL1RAPQ9NPH3 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms