Protein–RNA interactions for Protein: Q99687

MEIS3, Homeobox protein Meis3, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEIS3Q99687 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MEIS3Q99687 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
MEIS3Q99687 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
MEIS3Q99687 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
MEIS3Q99687 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MEIS3Q99687 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
MEIS3Q99687 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MEIS3Q99687 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MEIS3Q99687 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
MEIS3Q99687 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MEIS3Q99687 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MEIS3Q99687 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC23.34■■□□□ 1.33
MEIS3Q99687 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
MEIS3Q99687 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MEIS3Q99687 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
MEIS3Q99687 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MEIS3Q99687 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MEIS3Q99687 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MEIS3Q99687 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MEIS3Q99687 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
MEIS3Q99687 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
MEIS3Q99687 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
MEIS3Q99687 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
MEIS3Q99687 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
MEIS3Q99687 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
MEIS3Q99687 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
MEIS3Q99687 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
MEIS3Q99687 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
MEIS3Q99687 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
MEIS3Q99687 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
MEIS3Q99687 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
MEIS3Q99687 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
MEIS3Q99687 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
MEIS3Q99687 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
MEIS3Q99687 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
MEIS3Q99687 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
MEIS3Q99687 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
MEIS3Q99687 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
MEIS3Q99687 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
MEIS3Q99687 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
MEIS3Q99687 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
MEIS3Q99687 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
MEIS3Q99687 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
MEIS3Q99687 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
MEIS3Q99687 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
MEIS3Q99687 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
MEIS3Q99687 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MEIS3Q99687 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MEIS3Q99687 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
MEIS3Q99687 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
MEIS3Q99687 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MEIS3Q99687 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
MEIS3Q99687 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MEIS3Q99687 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC23.32■■□□□ 1.32
MEIS3Q99687 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
MEIS3Q99687 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC23.32■■□□□ 1.32
MEIS3Q99687 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
MEIS3Q99687 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MEIS3Q99687 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MEIS3Q99687 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
MEIS3Q99687 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
MEIS3Q99687 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MEIS3Q99687 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MEIS3Q99687 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
MEIS3Q99687 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MEIS3Q99687 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MEIS3Q99687 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
MEIS3Q99687 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MEIS3Q99687 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MEIS3Q99687 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MEIS3Q99687 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
MEIS3Q99687 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MEIS3Q99687 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MEIS3Q99687 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
MEIS3Q99687 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MEIS3Q99687 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
MEIS3Q99687 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MEIS3Q99687 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MEIS3Q99687 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MEIS3Q99687 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MEIS3Q99687 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
MEIS3Q99687 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
MEIS3Q99687 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
MEIS3Q99687 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
MEIS3Q99687 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
MEIS3Q99687 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
MEIS3Q99687 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MEIS3Q99687 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MEIS3Q99687 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MEIS3Q99687 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MEIS3Q99687 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
MEIS3Q99687 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
MEIS3Q99687 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
MEIS3Q99687 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
MEIS3Q99687 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
MEIS3Q99687 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
MEIS3Q99687 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MEIS3Q99687 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
MEIS3Q99687 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MEIS3Q99687 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms