Protein–RNA interactions for Protein: Q99536

VAT1, Synaptic vesicle membrane protein VAT-1 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAT1Q99536 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
VAT1Q99536 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
VAT1Q99536 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
VAT1Q99536 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
VAT1Q99536 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
VAT1Q99536 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
VAT1Q99536 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
VAT1Q99536 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
VAT1Q99536 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
VAT1Q99536 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
VAT1Q99536 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
VAT1Q99536 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC18.97■□□□□ 0.63
VAT1Q99536 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
VAT1Q99536 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
VAT1Q99536 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
VAT1Q99536 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
VAT1Q99536 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
VAT1Q99536 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
VAT1Q99536 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
VAT1Q99536 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
VAT1Q99536 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
VAT1Q99536 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
VAT1Q99536 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
VAT1Q99536 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
VAT1Q99536 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
VAT1Q99536 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
VAT1Q99536 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
VAT1Q99536 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
VAT1Q99536 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
VAT1Q99536 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
VAT1Q99536 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
VAT1Q99536 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
VAT1Q99536 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
VAT1Q99536 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
VAT1Q99536 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
VAT1Q99536 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
VAT1Q99536 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
VAT1Q99536 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
VAT1Q99536 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
VAT1Q99536 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
VAT1Q99536 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
VAT1Q99536 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
VAT1Q99536 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
VAT1Q99536 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
VAT1Q99536 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
VAT1Q99536 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
VAT1Q99536 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
VAT1Q99536 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
VAT1Q99536 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
VAT1Q99536 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC18.96■□□□□ 0.63
VAT1Q99536 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
VAT1Q99536 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
VAT1Q99536 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
VAT1Q99536 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
VAT1Q99536 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
VAT1Q99536 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
VAT1Q99536 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
VAT1Q99536 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
VAT1Q99536 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
VAT1Q99536 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
VAT1Q99536 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
VAT1Q99536 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
VAT1Q99536 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
VAT1Q99536 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
VAT1Q99536 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
VAT1Q99536 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
VAT1Q99536 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
VAT1Q99536 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
VAT1Q99536 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
VAT1Q99536 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
VAT1Q99536 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
VAT1Q99536 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
VAT1Q99536 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
VAT1Q99536 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
VAT1Q99536 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
VAT1Q99536 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
VAT1Q99536 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
VAT1Q99536 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
VAT1Q99536 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
VAT1Q99536 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
VAT1Q99536 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
VAT1Q99536 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
VAT1Q99536 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
VAT1Q99536 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
VAT1Q99536 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
VAT1Q99536 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
VAT1Q99536 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
VAT1Q99536 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
VAT1Q99536 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
VAT1Q99536 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
VAT1Q99536 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
VAT1Q99536 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
VAT1Q99536 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
VAT1Q99536 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
VAT1Q99536 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
VAT1Q99536 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
VAT1Q99536 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
VAT1Q99536 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
VAT1Q99536 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
VAT1Q99536 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms