Protein–RNA interactions for Protein: Q96KN3

PKNOX2, Homeobox protein PKNOX2, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKNOX2Q96KN3 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PKNOX2Q96KN3 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PKNOX2Q96KN3 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PKNOX2Q96KN3 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PKNOX2Q96KN3 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PKNOX2Q96KN3 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PKNOX2Q96KN3 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PKNOX2Q96KN3 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PKNOX2Q96KN3 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PKNOX2Q96KN3 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PKNOX2Q96KN3 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PKNOX2Q96KN3 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PKNOX2Q96KN3 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PKNOX2Q96KN3 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PKNOX2Q96KN3 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PKNOX2Q96KN3 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PKNOX2Q96KN3 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PKNOX2Q96KN3 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PKNOX2Q96KN3 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
PKNOX2Q96KN3 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
PKNOX2Q96KN3 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
PKNOX2Q96KN3 RGS12-202ENST00000338806 3010 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
PKNOX2Q96KN3 TBC1D2-201ENST00000342112 3046 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
PKNOX2Q96KN3 GOLGA2-212ENST00000609374 2973 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
PKNOX2Q96KN3 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
PKNOX2Q96KN3 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
PKNOX2Q96KN3 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
PKNOX2Q96KN3 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PKNOX2Q96KN3 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PKNOX2Q96KN3 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PKNOX2Q96KN3 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PKNOX2Q96KN3 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PKNOX2Q96KN3 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PKNOX2Q96KN3 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PKNOX2Q96KN3 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PKNOX2Q96KN3 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PKNOX2Q96KN3 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PKNOX2Q96KN3 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PKNOX2Q96KN3 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
PKNOX2Q96KN3 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PKNOX2Q96KN3 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PKNOX2Q96KN3 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PKNOX2Q96KN3 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PKNOX2Q96KN3 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PKNOX2Q96KN3 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PKNOX2Q96KN3 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
PKNOX2Q96KN3 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PKNOX2Q96KN3 PTPRA-201ENST00000216877 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PKNOX2Q96KN3 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PKNOX2Q96KN3 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PKNOX2Q96KN3 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PKNOX2Q96KN3 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PKNOX2Q96KN3 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PKNOX2Q96KN3 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PKNOX2Q96KN3 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PKNOX2Q96KN3 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PKNOX2Q96KN3 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PKNOX2Q96KN3 SYNGAP1-203ENST00000428982 4339 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PKNOX2Q96KN3 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PKNOX2Q96KN3 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PKNOX2Q96KN3 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PKNOX2Q96KN3 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PKNOX2Q96KN3 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PKNOX2Q96KN3 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PKNOX2Q96KN3 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PKNOX2Q96KN3 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PKNOX2Q96KN3 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PKNOX2Q96KN3 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
PKNOX2Q96KN3 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PKNOX2Q96KN3 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PKNOX2Q96KN3 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PKNOX2Q96KN3 AL137784.3-201ENST00000623858 2288 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
PKNOX2Q96KN3 ATP6V0A4-201ENST00000310018 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PKNOX2Q96KN3 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PKNOX2Q96KN3 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PKNOX2Q96KN3 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PKNOX2Q96KN3 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PKNOX2Q96KN3 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PKNOX2Q96KN3 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PKNOX2Q96KN3 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PKNOX2Q96KN3 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PKNOX2Q96KN3 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PKNOX2Q96KN3 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PKNOX2Q96KN3 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PKNOX2Q96KN3 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PKNOX2Q96KN3 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PKNOX2Q96KN3 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PKNOX2Q96KN3 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PKNOX2Q96KN3 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PKNOX2Q96KN3 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PKNOX2Q96KN3 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PKNOX2Q96KN3 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PKNOX2Q96KN3 AGBL3-202ENST00000435976 2495 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PKNOX2Q96KN3 FDFT1-223ENST00000615631 2462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PKNOX2Q96KN3 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PKNOX2Q96KN3 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PKNOX2Q96KN3 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PKNOX2Q96KN3 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PKNOX2Q96KN3 SRSF2-203ENST00000392485 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PKNOX2Q96KN3 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms