Protein–RNA interactions for Protein: Q96K76

USP47, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 47, humanhuman

Predictions only

Length 1,375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP47Q96K76 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
USP47Q96K76 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
USP47Q96K76 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
USP47Q96K76 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
USP47Q96K76 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
USP47Q96K76 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
USP47Q96K76 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
USP47Q96K76 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
USP47Q96K76 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
USP47Q96K76 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
USP47Q96K76 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
USP47Q96K76 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
USP47Q96K76 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
USP47Q96K76 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
USP47Q96K76 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
USP47Q96K76 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
USP47Q96K76 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
USP47Q96K76 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
USP47Q96K76 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
USP47Q96K76 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
USP47Q96K76 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
USP47Q96K76 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
USP47Q96K76 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
USP47Q96K76 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
USP47Q96K76 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
USP47Q96K76 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
USP47Q96K76 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
USP47Q96K76 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
USP47Q96K76 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
USP47Q96K76 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
USP47Q96K76 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
USP47Q96K76 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
USP47Q96K76 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
USP47Q96K76 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
USP47Q96K76 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
USP47Q96K76 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
USP47Q96K76 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
USP47Q96K76 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
USP47Q96K76 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
USP47Q96K76 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
USP47Q96K76 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
USP47Q96K76 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
USP47Q96K76 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
USP47Q96K76 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
USP47Q96K76 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
USP47Q96K76 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
USP47Q96K76 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
USP47Q96K76 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
USP47Q96K76 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
USP47Q96K76 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
USP47Q96K76 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
USP47Q96K76 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
USP47Q96K76 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
USP47Q96K76 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
USP47Q96K76 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
USP47Q96K76 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
USP47Q96K76 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
USP47Q96K76 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
USP47Q96K76 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
USP47Q96K76 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
USP47Q96K76 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
USP47Q96K76 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
USP47Q96K76 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
USP47Q96K76 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
USP47Q96K76 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
USP47Q96K76 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
USP47Q96K76 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
USP47Q96K76 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
USP47Q96K76 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
USP47Q96K76 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
USP47Q96K76 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
USP47Q96K76 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
USP47Q96K76 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
USP47Q96K76 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
USP47Q96K76 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
USP47Q96K76 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
USP47Q96K76 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
USP47Q96K76 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
USP47Q96K76 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
USP47Q96K76 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
USP47Q96K76 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
USP47Q96K76 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
USP47Q96K76 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
USP47Q96K76 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
USP47Q96K76 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
USP47Q96K76 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
USP47Q96K76 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
USP47Q96K76 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
USP47Q96K76 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
USP47Q96K76 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
USP47Q96K76 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
USP47Q96K76 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
USP47Q96K76 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.76
USP47Q96K76 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.76
USP47Q96K76 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
USP47Q96K76 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
USP47Q96K76 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
USP47Q96K76 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC26.01■■□□□ 1.75
USP47Q96K76 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
USP47Q96K76 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.6 ms