Protein–RNA interactions for Protein: Q92973

TNPO1, Transportin-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 898 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNPO1Q92973 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
TNPO1Q92973 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TNPO1Q92973 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TNPO1Q92973 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TNPO1Q92973 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TNPO1Q92973 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TNPO1Q92973 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TNPO1Q92973 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TNPO1Q92973 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TNPO1Q92973 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TNPO1Q92973 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TNPO1Q92973 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TNPO1Q92973 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TNPO1Q92973 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TNPO1Q92973 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TNPO1Q92973 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TNPO1Q92973 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TNPO1Q92973 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TNPO1Q92973 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TNPO1Q92973 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TNPO1Q92973 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TNPO1Q92973 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TNPO1Q92973 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TNPO1Q92973 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TNPO1Q92973 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TNPO1Q92973 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TNPO1Q92973 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TNPO1Q92973 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TNPO1Q92973 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TNPO1Q92973 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TNPO1Q92973 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TNPO1Q92973 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TNPO1Q92973 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TNPO1Q92973 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TNPO1Q92973 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TNPO1Q92973 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TNPO1Q92973 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TNPO1Q92973 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TNPO1Q92973 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TNPO1Q92973 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TNPO1Q92973 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TNPO1Q92973 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TNPO1Q92973 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TNPO1Q92973 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TNPO1Q92973 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TNPO1Q92973 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TNPO1Q92973 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TNPO1Q92973 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TNPO1Q92973 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TNPO1Q92973 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TNPO1Q92973 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TNPO1Q92973 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TNPO1Q92973 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TNPO1Q92973 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TNPO1Q92973 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TNPO1Q92973 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TNPO1Q92973 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TNPO1Q92973 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TNPO1Q92973 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
TNPO1Q92973 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TNPO1Q92973 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TNPO1Q92973 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TNPO1Q92973 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TNPO1Q92973 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TNPO1Q92973 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TNPO1Q92973 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TNPO1Q92973 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TNPO1Q92973 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TNPO1Q92973 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TNPO1Q92973 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TNPO1Q92973 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TNPO1Q92973 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TNPO1Q92973 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TNPO1Q92973 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TNPO1Q92973 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TNPO1Q92973 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TNPO1Q92973 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TNPO1Q92973 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
TNPO1Q92973 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TNPO1Q92973 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TNPO1Q92973 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TNPO1Q92973 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TNPO1Q92973 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TNPO1Q92973 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TNPO1Q92973 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TNPO1Q92973 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TNPO1Q92973 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TNPO1Q92973 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TNPO1Q92973 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TNPO1Q92973 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TNPO1Q92973 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TNPO1Q92973 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TNPO1Q92973 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TNPO1Q92973 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TNPO1Q92973 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TNPO1Q92973 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TNPO1Q92973 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TNPO1Q92973 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TNPO1Q92973 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TNPO1Q92973 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms