Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXU2

DNAAF4, Dynein assembly factor 4, axonemal, humanhuman

Predictions only

Length 420 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAAF4Q8WXU2 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
DNAAF4Q8WXU2 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
DNAAF4Q8WXU2 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
DNAAF4Q8WXU2 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
DNAAF4Q8WXU2 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
DNAAF4Q8WXU2 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
DNAAF4Q8WXU2 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
DNAAF4Q8WXU2 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
DNAAF4Q8WXU2 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
DNAAF4Q8WXU2 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
DNAAF4Q8WXU2 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
DNAAF4Q8WXU2 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
DNAAF4Q8WXU2 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
DNAAF4Q8WXU2 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
DNAAF4Q8WXU2 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
DNAAF4Q8WXU2 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
DNAAF4Q8WXU2 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
DNAAF4Q8WXU2 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
DNAAF4Q8WXU2 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
DNAAF4Q8WXU2 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
DNAAF4Q8WXU2 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
DNAAF4Q8WXU2 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
DNAAF4Q8WXU2 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
DNAAF4Q8WXU2 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC23.45■■□□□ 1.35
DNAAF4Q8WXU2 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
DNAAF4Q8WXU2 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
DNAAF4Q8WXU2 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
DNAAF4Q8WXU2 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
DNAAF4Q8WXU2 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
DNAAF4Q8WXU2 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
DNAAF4Q8WXU2 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
DNAAF4Q8WXU2 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
DNAAF4Q8WXU2 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
DNAAF4Q8WXU2 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
DNAAF4Q8WXU2 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
DNAAF4Q8WXU2 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
DNAAF4Q8WXU2 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
DNAAF4Q8WXU2 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
DNAAF4Q8WXU2 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
DNAAF4Q8WXU2 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
DNAAF4Q8WXU2 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
DNAAF4Q8WXU2 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
DNAAF4Q8WXU2 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
DNAAF4Q8WXU2 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
DNAAF4Q8WXU2 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
DNAAF4Q8WXU2 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
DNAAF4Q8WXU2 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
DNAAF4Q8WXU2 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
DNAAF4Q8WXU2 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
DNAAF4Q8WXU2 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
DNAAF4Q8WXU2 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
DNAAF4Q8WXU2 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
DNAAF4Q8WXU2 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
DNAAF4Q8WXU2 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
DNAAF4Q8WXU2 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
DNAAF4Q8WXU2 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
DNAAF4Q8WXU2 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
DNAAF4Q8WXU2 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
DNAAF4Q8WXU2 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
DNAAF4Q8WXU2 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
DNAAF4Q8WXU2 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
DNAAF4Q8WXU2 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
DNAAF4Q8WXU2 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
DNAAF4Q8WXU2 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
DNAAF4Q8WXU2 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
DNAAF4Q8WXU2 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
DNAAF4Q8WXU2 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
DNAAF4Q8WXU2 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
DNAAF4Q8WXU2 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
DNAAF4Q8WXU2 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
DNAAF4Q8WXU2 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
DNAAF4Q8WXU2 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
DNAAF4Q8WXU2 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
DNAAF4Q8WXU2 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
DNAAF4Q8WXU2 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
DNAAF4Q8WXU2 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
DNAAF4Q8WXU2 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
DNAAF4Q8WXU2 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
DNAAF4Q8WXU2 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
DNAAF4Q8WXU2 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
DNAAF4Q8WXU2 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
DNAAF4Q8WXU2 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
DNAAF4Q8WXU2 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
DNAAF4Q8WXU2 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
DNAAF4Q8WXU2 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
DNAAF4Q8WXU2 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
DNAAF4Q8WXU2 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
DNAAF4Q8WXU2 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
DNAAF4Q8WXU2 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
DNAAF4Q8WXU2 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
DNAAF4Q8WXU2 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
DNAAF4Q8WXU2 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
DNAAF4Q8WXU2 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
DNAAF4Q8WXU2 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
DNAAF4Q8WXU2 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
DNAAF4Q8WXU2 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
DNAAF4Q8WXU2 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
DNAAF4Q8WXU2 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
DNAAF4Q8WXU2 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
DNAAF4Q8WXU2 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms