Protein–RNA interactions for Protein: Q8N5G0

SMIM20, Small integral membrane protein 20, humanhuman

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Length 67 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM20Q8N5G0 CALHM1-201ENST00000329905 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SMIM20Q8N5G0 SFI1-229ENST00000540643 4226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SMIM20Q8N5G0 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SMIM20Q8N5G0 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SMIM20Q8N5G0 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SMIM20Q8N5G0 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SMIM20Q8N5G0 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SMIM20Q8N5G0 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SMIM20Q8N5G0 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SMIM20Q8N5G0 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SMIM20Q8N5G0 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SMIM20Q8N5G0 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SMIM20Q8N5G0 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SMIM20Q8N5G0 PPRC1-203ENST00000413464 4580 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SMIM20Q8N5G0 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SMIM20Q8N5G0 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SMIM20Q8N5G0 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SMIM20Q8N5G0 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
SMIM20Q8N5G0 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SMIM20Q8N5G0 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SMIM20Q8N5G0 ZDHHC8-203ENST00000405930 3112 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SMIM20Q8N5G0 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SMIM20Q8N5G0 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SMIM20Q8N5G0 PSD-209ENST00000611678 3382 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SMIM20Q8N5G0 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SMIM20Q8N5G0 CDT1-201ENST00000301019 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SMIM20Q8N5G0 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SMIM20Q8N5G0 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SMIM20Q8N5G0 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SMIM20Q8N5G0 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SMIM20Q8N5G0 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SMIM20Q8N5G0 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SMIM20Q8N5G0 EGR2-202ENST00000411732 2824 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SMIM20Q8N5G0 NALCN-AS1-201ENST00000457843 2846 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SMIM20Q8N5G0 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SMIM20Q8N5G0 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SMIM20Q8N5G0 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SMIM20Q8N5G0 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SMIM20Q8N5G0 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SMIM20Q8N5G0 SMTN-201ENST00000333137 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
SMIM20Q8N5G0 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
SMIM20Q8N5G0 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
SMIM20Q8N5G0 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
SMIM20Q8N5G0 OSBPL3-201ENST00000313367 6760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
SMIM20Q8N5G0 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
SMIM20Q8N5G0 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
SMIM20Q8N5G0 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
SMIM20Q8N5G0 OPA1-203ENST00000361715 6384 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
SMIM20Q8N5G0 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
SMIM20Q8N5G0 WDR59-201ENST00000262144 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
SMIM20Q8N5G0 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
SMIM20Q8N5G0 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
SMIM20Q8N5G0 C9orf139-202ENST00000623196 4990 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
SMIM20Q8N5G0 NUP98-201ENST00000324932 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
SMIM20Q8N5G0 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
SMIM20Q8N5G0 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
SMIM20Q8N5G0 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
SMIM20Q8N5G0 MARS-201ENST00000262027 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
SMIM20Q8N5G0 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
SMIM20Q8N5G0 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
SMIM20Q8N5G0 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
SMIM20Q8N5G0 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
SMIM20Q8N5G0 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
SMIM20Q8N5G0 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
SMIM20Q8N5G0 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
SMIM20Q8N5G0 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
SMIM20Q8N5G0 RBM47-203ENST00000381795 4473 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
SMIM20Q8N5G0 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
SMIM20Q8N5G0 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
SMIM20Q8N5G0 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
SMIM20Q8N5G0 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
SMIM20Q8N5G0 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
SMIM20Q8N5G0 XRCC1-201ENST00000262887 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
SMIM20Q8N5G0 AL031728.1-201ENST00000449034 2479 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
SMIM20Q8N5G0 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
SMIM20Q8N5G0 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
SMIM20Q8N5G0 ROCK1-201ENST00000399799 9484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
SMIM20Q8N5G0 NFATC4-206ENST00000539237 5686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
SMIM20Q8N5G0 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
SMIM20Q8N5G0 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
SMIM20Q8N5G0 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
SMIM20Q8N5G0 LRP8-201ENST00000306052 7648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
SMIM20Q8N5G0 PPM1A-203ENST00000395076 8184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
SMIM20Q8N5G0 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
SMIM20Q8N5G0 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
SMIM20Q8N5G0 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
SMIM20Q8N5G0 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
SMIM20Q8N5G0 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
SMIM20Q8N5G0 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
SMIM20Q8N5G0 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
SMIM20Q8N5G0 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
SMIM20Q8N5G0 MAP3K12-205ENST00000547488 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
SMIM20Q8N5G0 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
SMIM20Q8N5G0 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
SMIM20Q8N5G0 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
SMIM20Q8N5G0 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
SMIM20Q8N5G0 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
SMIM20Q8N5G0 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
SMIM20Q8N5G0 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
SMIM20Q8N5G0 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
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