Protein–RNA interactions for Protein: Q86UW8

HAPLN4, Hyaluronan and proteoglycan link protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 402 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HAPLN4Q86UW8 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
HAPLN4Q86UW8 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
HAPLN4Q86UW8 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HAPLN4Q86UW8 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
HAPLN4Q86UW8 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
HAPLN4Q86UW8 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HAPLN4Q86UW8 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HAPLN4Q86UW8 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
HAPLN4Q86UW8 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
HAPLN4Q86UW8 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
HAPLN4Q86UW8 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
HAPLN4Q86UW8 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
HAPLN4Q86UW8 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HAPLN4Q86UW8 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
HAPLN4Q86UW8 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
HAPLN4Q86UW8 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
HAPLN4Q86UW8 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HAPLN4Q86UW8 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HAPLN4Q86UW8 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
HAPLN4Q86UW8 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HAPLN4Q86UW8 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
HAPLN4Q86UW8 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
HAPLN4Q86UW8 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
HAPLN4Q86UW8 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC15.08■□□□□ 0
HAPLN4Q86UW8 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC15.08■□□□□ 0
HAPLN4Q86UW8 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
HAPLN4Q86UW8 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
HAPLN4Q86UW8 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
HAPLN4Q86UW8 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HAPLN4Q86UW8 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HAPLN4Q86UW8 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HAPLN4Q86UW8 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
HAPLN4Q86UW8 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
HAPLN4Q86UW8 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HAPLN4Q86UW8 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC15.07■□□□□ 0
HAPLN4Q86UW8 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
HAPLN4Q86UW8 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC15.07■□□□□ 0
HAPLN4Q86UW8 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
HAPLN4Q86UW8 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
HAPLN4Q86UW8 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HAPLN4Q86UW8 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HAPLN4Q86UW8 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HAPLN4Q86UW8 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HAPLN4Q86UW8 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HAPLN4Q86UW8 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
HAPLN4Q86UW8 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HAPLN4Q86UW8 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
HAPLN4Q86UW8 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HAPLN4Q86UW8 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC15.07■□□□□ 0
HAPLN4Q86UW8 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HAPLN4Q86UW8 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HAPLN4Q86UW8 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HAPLN4Q86UW8 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
HAPLN4Q86UW8 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
HAPLN4Q86UW8 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HAPLN4Q86UW8 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HAPLN4Q86UW8 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HAPLN4Q86UW8 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
HAPLN4Q86UW8 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HAPLN4Q86UW8 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HAPLN4Q86UW8 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HAPLN4Q86UW8 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HAPLN4Q86UW8 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HAPLN4Q86UW8 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
HAPLN4Q86UW8 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
HAPLN4Q86UW8 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC15.06■□□□□ 0
HAPLN4Q86UW8 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
HAPLN4Q86UW8 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HAPLN4Q86UW8 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HAPLN4Q86UW8 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC15.06■□□□□ 0
HAPLN4Q86UW8 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
HAPLN4Q86UW8 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HAPLN4Q86UW8 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC15.06■□□□□ 0
HAPLN4Q86UW8 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HAPLN4Q86UW8 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
HAPLN4Q86UW8 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
HAPLN4Q86UW8 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC15.06■□□□□ 0
HAPLN4Q86UW8 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HAPLN4Q86UW8 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HAPLN4Q86UW8 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
HAPLN4Q86UW8 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HAPLN4Q86UW8 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HAPLN4Q86UW8 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
HAPLN4Q86UW8 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
HAPLN4Q86UW8 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
HAPLN4Q86UW8 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
HAPLN4Q86UW8 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC15.05■□□□□ 0
HAPLN4Q86UW8 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
HAPLN4Q86UW8 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
HAPLN4Q86UW8 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ 0
HAPLN4Q86UW8 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
HAPLN4Q86UW8 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
HAPLN4Q86UW8 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
HAPLN4Q86UW8 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HAPLN4Q86UW8 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HAPLN4Q86UW8 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HAPLN4Q86UW8 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HAPLN4Q86UW8 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
HAPLN4Q86UW8 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC15.05■□□□□ -0
HAPLN4Q86UW8 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms