Protein–RNA interactions for Protein: Q71RG4

TMUB2, Transmembrane and ubiquitin-like domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 321 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMUB2Q71RG4 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMUB2Q71RG4 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMUB2Q71RG4 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMUB2Q71RG4 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMUB2Q71RG4 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMUB2Q71RG4 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMUB2Q71RG4 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMUB2Q71RG4 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMUB2Q71RG4 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMUB2Q71RG4 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMUB2Q71RG4 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMUB2Q71RG4 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMUB2Q71RG4 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMUB2Q71RG4 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMUB2Q71RG4 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMUB2Q71RG4 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMUB2Q71RG4 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMUB2Q71RG4 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMUB2Q71RG4 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMUB2Q71RG4 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMUB2Q71RG4 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMUB2Q71RG4 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMUB2Q71RG4 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMUB2Q71RG4 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMUB2Q71RG4 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMUB2Q71RG4 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMUB2Q71RG4 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMUB2Q71RG4 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMUB2Q71RG4 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMUB2Q71RG4 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMUB2Q71RG4 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMUB2Q71RG4 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMUB2Q71RG4 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMUB2Q71RG4 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMUB2Q71RG4 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMUB2Q71RG4 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMUB2Q71RG4 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMUB2Q71RG4 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMUB2Q71RG4 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TMUB2Q71RG4 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMUB2Q71RG4 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMUB2Q71RG4 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMUB2Q71RG4 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMUB2Q71RG4 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMUB2Q71RG4 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMUB2Q71RG4 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TMUB2Q71RG4 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMUB2Q71RG4 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMUB2Q71RG4 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMUB2Q71RG4 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMUB2Q71RG4 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMUB2Q71RG4 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
TMUB2Q71RG4 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMUB2Q71RG4 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMUB2Q71RG4 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMUB2Q71RG4 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMUB2Q71RG4 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMUB2Q71RG4 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMUB2Q71RG4 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMUB2Q71RG4 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMUB2Q71RG4 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMUB2Q71RG4 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMUB2Q71RG4 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMUB2Q71RG4 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMUB2Q71RG4 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMUB2Q71RG4 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMUB2Q71RG4 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMUB2Q71RG4 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMUB2Q71RG4 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMUB2Q71RG4 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMUB2Q71RG4 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMUB2Q71RG4 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
TMUB2Q71RG4 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMUB2Q71RG4 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMUB2Q71RG4 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMUB2Q71RG4 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMUB2Q71RG4 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMUB2Q71RG4 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMUB2Q71RG4 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
TMUB2Q71RG4 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMUB2Q71RG4 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMUB2Q71RG4 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMUB2Q71RG4 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMUB2Q71RG4 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
TMUB2Q71RG4 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMUB2Q71RG4 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMUB2Q71RG4 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMUB2Q71RG4 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMUB2Q71RG4 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMUB2Q71RG4 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMUB2Q71RG4 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMUB2Q71RG4 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
TMUB2Q71RG4 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMUB2Q71RG4 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMUB2Q71RG4 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMUB2Q71RG4 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMUB2Q71RG4 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMUB2Q71RG4 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMUB2Q71RG4 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMUB2Q71RG4 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms