Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZW61

BBS12, Bardet-Biedl syndrome 12 protein, humanhuman

Predictions only

Length 710 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BBS12Q6ZW61 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
BBS12Q6ZW61 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
BBS12Q6ZW61 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
BBS12Q6ZW61 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
BBS12Q6ZW61 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
BBS12Q6ZW61 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
BBS12Q6ZW61 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
BBS12Q6ZW61 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
BBS12Q6ZW61 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
BBS12Q6ZW61 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
BBS12Q6ZW61 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
BBS12Q6ZW61 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
BBS12Q6ZW61 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
BBS12Q6ZW61 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
BBS12Q6ZW61 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
BBS12Q6ZW61 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
BBS12Q6ZW61 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
BBS12Q6ZW61 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
BBS12Q6ZW61 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
BBS12Q6ZW61 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
BBS12Q6ZW61 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
BBS12Q6ZW61 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
BBS12Q6ZW61 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
BBS12Q6ZW61 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
BBS12Q6ZW61 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
BBS12Q6ZW61 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
BBS12Q6ZW61 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
BBS12Q6ZW61 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
BBS12Q6ZW61 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
BBS12Q6ZW61 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
BBS12Q6ZW61 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
BBS12Q6ZW61 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
BBS12Q6ZW61 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
BBS12Q6ZW61 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
BBS12Q6ZW61 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
BBS12Q6ZW61 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
BBS12Q6ZW61 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
BBS12Q6ZW61 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
BBS12Q6ZW61 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
BBS12Q6ZW61 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
BBS12Q6ZW61 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
BBS12Q6ZW61 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
BBS12Q6ZW61 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
BBS12Q6ZW61 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
BBS12Q6ZW61 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
BBS12Q6ZW61 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
BBS12Q6ZW61 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
BBS12Q6ZW61 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
BBS12Q6ZW61 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
BBS12Q6ZW61 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
BBS12Q6ZW61 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
BBS12Q6ZW61 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
BBS12Q6ZW61 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
BBS12Q6ZW61 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
BBS12Q6ZW61 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
BBS12Q6ZW61 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
BBS12Q6ZW61 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
BBS12Q6ZW61 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
BBS12Q6ZW61 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
BBS12Q6ZW61 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
BBS12Q6ZW61 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
BBS12Q6ZW61 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
BBS12Q6ZW61 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
BBS12Q6ZW61 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC19.22■□□□□ 0.67
BBS12Q6ZW61 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
BBS12Q6ZW61 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
BBS12Q6ZW61 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
BBS12Q6ZW61 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
BBS12Q6ZW61 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
BBS12Q6ZW61 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
BBS12Q6ZW61 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
BBS12Q6ZW61 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
BBS12Q6ZW61 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
BBS12Q6ZW61 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
BBS12Q6ZW61 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
BBS12Q6ZW61 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
BBS12Q6ZW61 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
BBS12Q6ZW61 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
BBS12Q6ZW61 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
BBS12Q6ZW61 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
BBS12Q6ZW61 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
BBS12Q6ZW61 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
BBS12Q6ZW61 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
BBS12Q6ZW61 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
BBS12Q6ZW61 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
BBS12Q6ZW61 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
BBS12Q6ZW61 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
BBS12Q6ZW61 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
BBS12Q6ZW61 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
BBS12Q6ZW61 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
BBS12Q6ZW61 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
BBS12Q6ZW61 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
BBS12Q6ZW61 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
BBS12Q6ZW61 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
BBS12Q6ZW61 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
BBS12Q6ZW61 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
BBS12Q6ZW61 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
BBS12Q6ZW61 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
BBS12Q6ZW61 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
BBS12Q6ZW61 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.5 ms