Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZRK6

CCDC73, Coiled-coil domain-containing protein 73, humanhuman

Predictions only

Length 1,079 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC73Q6ZRK6 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC73Q6ZRK6 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC73Q6ZRK6 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC73Q6ZRK6 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC73Q6ZRK6 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC73Q6ZRK6 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC73Q6ZRK6 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC73Q6ZRK6 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC73Q6ZRK6 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC73Q6ZRK6 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC73Q6ZRK6 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC73Q6ZRK6 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC73Q6ZRK6 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC73Q6ZRK6 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC73Q6ZRK6 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC73Q6ZRK6 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC73Q6ZRK6 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC73Q6ZRK6 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC73Q6ZRK6 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC73Q6ZRK6 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC73Q6ZRK6 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC73Q6ZRK6 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC73Q6ZRK6 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC73Q6ZRK6 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC73Q6ZRK6 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC73Q6ZRK6 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC73Q6ZRK6 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC73Q6ZRK6 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC73Q6ZRK6 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC73Q6ZRK6 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC73Q6ZRK6 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC73Q6ZRK6 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC73Q6ZRK6 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC73Q6ZRK6 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC73Q6ZRK6 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC73Q6ZRK6 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC73Q6ZRK6 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC73Q6ZRK6 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC73Q6ZRK6 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC73Q6ZRK6 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC73Q6ZRK6 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC73Q6ZRK6 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC73Q6ZRK6 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC73Q6ZRK6 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC73Q6ZRK6 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC73Q6ZRK6 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC73Q6ZRK6 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC73Q6ZRK6 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC73Q6ZRK6 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC73Q6ZRK6 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC73Q6ZRK6 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC73Q6ZRK6 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC73Q6ZRK6 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC73Q6ZRK6 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC73Q6ZRK6 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC73Q6ZRK6 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC73Q6ZRK6 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC73Q6ZRK6 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC73Q6ZRK6 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC73Q6ZRK6 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC73Q6ZRK6 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC73Q6ZRK6 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC73Q6ZRK6 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC73Q6ZRK6 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC73Q6ZRK6 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC73Q6ZRK6 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC73Q6ZRK6 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC73Q6ZRK6 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC73Q6ZRK6 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC73Q6ZRK6 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC73Q6ZRK6 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC73Q6ZRK6 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC73Q6ZRK6 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC73Q6ZRK6 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC73Q6ZRK6 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC73Q6ZRK6 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC73Q6ZRK6 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC73Q6ZRK6 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC73Q6ZRK6 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC73Q6ZRK6 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC73Q6ZRK6 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC73Q6ZRK6 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC73Q6ZRK6 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC73Q6ZRK6 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC73Q6ZRK6 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC73Q6ZRK6 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC73Q6ZRK6 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC73Q6ZRK6 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CCDC73Q6ZRK6 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CCDC73Q6ZRK6 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CCDC73Q6ZRK6 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CCDC73Q6ZRK6 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CCDC73Q6ZRK6 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC73Q6ZRK6 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC73Q6ZRK6 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC73Q6ZRK6 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC73Q6ZRK6 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC73Q6ZRK6 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC73Q6ZRK6 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC73Q6ZRK6 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms