Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWZ7

ABRAXAS1, BRCA1-A complex subunit Abraxas 1, humanhuman

Predictions only

Length 409 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABRAXAS1Q6UWZ7 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ABRAXAS1Q6UWZ7 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ABRAXAS1Q6UWZ7 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ABRAXAS1Q6UWZ7 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ABRAXAS1Q6UWZ7 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ABRAXAS1Q6UWZ7 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ABRAXAS1Q6UWZ7 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ABRAXAS1Q6UWZ7 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ABRAXAS1Q6UWZ7 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ABRAXAS1Q6UWZ7 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ABRAXAS1Q6UWZ7 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ABRAXAS1Q6UWZ7 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ABRAXAS1Q6UWZ7 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ABRAXAS1Q6UWZ7 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ABRAXAS1Q6UWZ7 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ABRAXAS1Q6UWZ7 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ABRAXAS1Q6UWZ7 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ABRAXAS1Q6UWZ7 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ABRAXAS1Q6UWZ7 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ABRAXAS1Q6UWZ7 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ABRAXAS1Q6UWZ7 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ABRAXAS1Q6UWZ7 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ABRAXAS1Q6UWZ7 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ABRAXAS1Q6UWZ7 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ABRAXAS1Q6UWZ7 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ABRAXAS1Q6UWZ7 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ABRAXAS1Q6UWZ7 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ABRAXAS1Q6UWZ7 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ABRAXAS1Q6UWZ7 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ABRAXAS1Q6UWZ7 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ABRAXAS1Q6UWZ7 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ABRAXAS1Q6UWZ7 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ABRAXAS1Q6UWZ7 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ABRAXAS1Q6UWZ7 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ABRAXAS1Q6UWZ7 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
ABRAXAS1Q6UWZ7 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ABRAXAS1Q6UWZ7 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ABRAXAS1Q6UWZ7 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ABRAXAS1Q6UWZ7 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ABRAXAS1Q6UWZ7 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
ABRAXAS1Q6UWZ7 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
ABRAXAS1Q6UWZ7 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ABRAXAS1Q6UWZ7 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
ABRAXAS1Q6UWZ7 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ABRAXAS1Q6UWZ7 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ABRAXAS1Q6UWZ7 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ABRAXAS1Q6UWZ7 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ABRAXAS1Q6UWZ7 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ABRAXAS1Q6UWZ7 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
ABRAXAS1Q6UWZ7 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ABRAXAS1Q6UWZ7 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ABRAXAS1Q6UWZ7 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ABRAXAS1Q6UWZ7 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ABRAXAS1Q6UWZ7 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ABRAXAS1Q6UWZ7 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ABRAXAS1Q6UWZ7 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ABRAXAS1Q6UWZ7 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ABRAXAS1Q6UWZ7 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ABRAXAS1Q6UWZ7 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ABRAXAS1Q6UWZ7 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ABRAXAS1Q6UWZ7 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ABRAXAS1Q6UWZ7 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ABRAXAS1Q6UWZ7 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ABRAXAS1Q6UWZ7 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ABRAXAS1Q6UWZ7 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ABRAXAS1Q6UWZ7 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ABRAXAS1Q6UWZ7 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ABRAXAS1Q6UWZ7 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ABRAXAS1Q6UWZ7 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ABRAXAS1Q6UWZ7 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ABRAXAS1Q6UWZ7 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ABRAXAS1Q6UWZ7 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ABRAXAS1Q6UWZ7 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ABRAXAS1Q6UWZ7 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ABRAXAS1Q6UWZ7 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ABRAXAS1Q6UWZ7 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ABRAXAS1Q6UWZ7 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ABRAXAS1Q6UWZ7 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ABRAXAS1Q6UWZ7 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ABRAXAS1Q6UWZ7 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ABRAXAS1Q6UWZ7 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ABRAXAS1Q6UWZ7 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ABRAXAS1Q6UWZ7 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
ABRAXAS1Q6UWZ7 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
ABRAXAS1Q6UWZ7 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ABRAXAS1Q6UWZ7 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ABRAXAS1Q6UWZ7 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ABRAXAS1Q6UWZ7 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ABRAXAS1Q6UWZ7 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ABRAXAS1Q6UWZ7 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ABRAXAS1Q6UWZ7 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
ABRAXAS1Q6UWZ7 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
ABRAXAS1Q6UWZ7 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ABRAXAS1Q6UWZ7 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ABRAXAS1Q6UWZ7 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ABRAXAS1Q6UWZ7 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ABRAXAS1Q6UWZ7 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
ABRAXAS1Q6UWZ7 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.54
ABRAXAS1Q6UWZ7 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ABRAXAS1Q6UWZ7 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.5 ms