Protein–RNA interactions for Protein: Q6TDU7

CASC1, Protein CASC1, humanhuman

Predictions only

Length 716 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASC1Q6TDU7 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CASC1Q6TDU7 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CASC1Q6TDU7 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CASC1Q6TDU7 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CASC1Q6TDU7 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CASC1Q6TDU7 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CASC1Q6TDU7 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CASC1Q6TDU7 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CASC1Q6TDU7 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CASC1Q6TDU7 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CASC1Q6TDU7 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CASC1Q6TDU7 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CASC1Q6TDU7 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CASC1Q6TDU7 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CASC1Q6TDU7 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CASC1Q6TDU7 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CASC1Q6TDU7 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CASC1Q6TDU7 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CASC1Q6TDU7 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CASC1Q6TDU7 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CASC1Q6TDU7 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CASC1Q6TDU7 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CASC1Q6TDU7 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CASC1Q6TDU7 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CASC1Q6TDU7 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CASC1Q6TDU7 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CASC1Q6TDU7 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CASC1Q6TDU7 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CASC1Q6TDU7 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CASC1Q6TDU7 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CASC1Q6TDU7 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CASC1Q6TDU7 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CASC1Q6TDU7 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CASC1Q6TDU7 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CASC1Q6TDU7 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CASC1Q6TDU7 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CASC1Q6TDU7 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CASC1Q6TDU7 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CASC1Q6TDU7 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CASC1Q6TDU7 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CASC1Q6TDU7 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CASC1Q6TDU7 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CASC1Q6TDU7 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CASC1Q6TDU7 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CASC1Q6TDU7 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CASC1Q6TDU7 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CASC1Q6TDU7 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CASC1Q6TDU7 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CASC1Q6TDU7 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CASC1Q6TDU7 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CASC1Q6TDU7 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CASC1Q6TDU7 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CASC1Q6TDU7 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CASC1Q6TDU7 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CASC1Q6TDU7 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CASC1Q6TDU7 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CASC1Q6TDU7 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CASC1Q6TDU7 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CASC1Q6TDU7 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CASC1Q6TDU7 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CASC1Q6TDU7 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CASC1Q6TDU7 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CASC1Q6TDU7 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CASC1Q6TDU7 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CASC1Q6TDU7 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CASC1Q6TDU7 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CASC1Q6TDU7 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CASC1Q6TDU7 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CASC1Q6TDU7 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CASC1Q6TDU7 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CASC1Q6TDU7 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CASC1Q6TDU7 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CASC1Q6TDU7 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CASC1Q6TDU7 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CASC1Q6TDU7 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CASC1Q6TDU7 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CASC1Q6TDU7 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CASC1Q6TDU7 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CASC1Q6TDU7 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CASC1Q6TDU7 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CASC1Q6TDU7 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CASC1Q6TDU7 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CASC1Q6TDU7 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CASC1Q6TDU7 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CASC1Q6TDU7 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CASC1Q6TDU7 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CASC1Q6TDU7 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CASC1Q6TDU7 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CASC1Q6TDU7 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CASC1Q6TDU7 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CASC1Q6TDU7 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CASC1Q6TDU7 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CASC1Q6TDU7 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CASC1Q6TDU7 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CASC1Q6TDU7 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CASC1Q6TDU7 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CASC1Q6TDU7 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CASC1Q6TDU7 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CASC1Q6TDU7 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CASC1Q6TDU7 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms