Protein–RNA interactions for Protein: Q676U5

ATG16L1, Autophagy-related protein 16-1, humanhuman

Predictions only

Length 607 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG16L1Q676U5 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATG16L1Q676U5 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATG16L1Q676U5 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATG16L1Q676U5 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATG16L1Q676U5 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATG16L1Q676U5 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATG16L1Q676U5 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATG16L1Q676U5 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATG16L1Q676U5 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATG16L1Q676U5 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATG16L1Q676U5 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATG16L1Q676U5 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATG16L1Q676U5 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATG16L1Q676U5 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATG16L1Q676U5 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATG16L1Q676U5 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATG16L1Q676U5 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATG16L1Q676U5 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATG16L1Q676U5 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATG16L1Q676U5 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
ATG16L1Q676U5 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATG16L1Q676U5 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATG16L1Q676U5 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATG16L1Q676U5 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATG16L1Q676U5 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATG16L1Q676U5 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATG16L1Q676U5 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATG16L1Q676U5 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATG16L1Q676U5 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATG16L1Q676U5 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATG16L1Q676U5 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATG16L1Q676U5 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATG16L1Q676U5 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATG16L1Q676U5 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATG16L1Q676U5 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATG16L1Q676U5 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATG16L1Q676U5 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATG16L1Q676U5 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATG16L1Q676U5 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATG16L1Q676U5 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATG16L1Q676U5 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATG16L1Q676U5 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATG16L1Q676U5 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATG16L1Q676U5 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATG16L1Q676U5 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATG16L1Q676U5 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATG16L1Q676U5 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATG16L1Q676U5 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATG16L1Q676U5 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATG16L1Q676U5 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATG16L1Q676U5 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
ATG16L1Q676U5 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATG16L1Q676U5 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATG16L1Q676U5 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATG16L1Q676U5 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATG16L1Q676U5 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATG16L1Q676U5 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATG16L1Q676U5 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATG16L1Q676U5 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATG16L1Q676U5 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATG16L1Q676U5 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATG16L1Q676U5 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATG16L1Q676U5 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATG16L1Q676U5 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATG16L1Q676U5 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATG16L1Q676U5 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATG16L1Q676U5 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATG16L1Q676U5 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATG16L1Q676U5 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATG16L1Q676U5 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATG16L1Q676U5 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATG16L1Q676U5 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
ATG16L1Q676U5 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATG16L1Q676U5 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATG16L1Q676U5 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
ATG16L1Q676U5 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATG16L1Q676U5 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATG16L1Q676U5 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATG16L1Q676U5 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
ATG16L1Q676U5 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
ATG16L1Q676U5 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATG16L1Q676U5 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATG16L1Q676U5 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATG16L1Q676U5 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATG16L1Q676U5 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATG16L1Q676U5 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATG16L1Q676U5 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATG16L1Q676U5 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATG16L1Q676U5 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATG16L1Q676U5 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATG16L1Q676U5 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATG16L1Q676U5 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATG16L1Q676U5 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATG16L1Q676U5 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATG16L1Q676U5 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATG16L1Q676U5 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
ATG16L1Q676U5 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATG16L1Q676U5 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATG16L1Q676U5 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATG16L1Q676U5 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.9 ms