Protein–RNA interactions for Protein: Q5JSH3

WDR44, WD repeat-containing protein 44, humanhuman

Predictions only

Length 913 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR44Q5JSH3 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
WDR44Q5JSH3 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
WDR44Q5JSH3 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
WDR44Q5JSH3 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
WDR44Q5JSH3 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
WDR44Q5JSH3 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
WDR44Q5JSH3 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
WDR44Q5JSH3 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
WDR44Q5JSH3 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
WDR44Q5JSH3 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
WDR44Q5JSH3 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
WDR44Q5JSH3 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
WDR44Q5JSH3 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
WDR44Q5JSH3 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
WDR44Q5JSH3 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
WDR44Q5JSH3 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
WDR44Q5JSH3 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
WDR44Q5JSH3 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
WDR44Q5JSH3 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
WDR44Q5JSH3 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
WDR44Q5JSH3 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
WDR44Q5JSH3 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
WDR44Q5JSH3 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
WDR44Q5JSH3 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
WDR44Q5JSH3 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
WDR44Q5JSH3 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
WDR44Q5JSH3 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
WDR44Q5JSH3 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
WDR44Q5JSH3 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
WDR44Q5JSH3 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
WDR44Q5JSH3 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
WDR44Q5JSH3 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
WDR44Q5JSH3 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
WDR44Q5JSH3 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
WDR44Q5JSH3 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
WDR44Q5JSH3 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
WDR44Q5JSH3 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
WDR44Q5JSH3 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
WDR44Q5JSH3 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
WDR44Q5JSH3 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
WDR44Q5JSH3 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
WDR44Q5JSH3 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
WDR44Q5JSH3 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
WDR44Q5JSH3 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
WDR44Q5JSH3 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
WDR44Q5JSH3 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
WDR44Q5JSH3 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
WDR44Q5JSH3 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
WDR44Q5JSH3 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
WDR44Q5JSH3 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
WDR44Q5JSH3 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
WDR44Q5JSH3 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
WDR44Q5JSH3 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
WDR44Q5JSH3 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
WDR44Q5JSH3 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
WDR44Q5JSH3 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
WDR44Q5JSH3 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
WDR44Q5JSH3 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
WDR44Q5JSH3 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
WDR44Q5JSH3 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
WDR44Q5JSH3 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
WDR44Q5JSH3 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
WDR44Q5JSH3 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
WDR44Q5JSH3 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
WDR44Q5JSH3 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
WDR44Q5JSH3 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
WDR44Q5JSH3 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
WDR44Q5JSH3 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
WDR44Q5JSH3 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
WDR44Q5JSH3 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
WDR44Q5JSH3 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
WDR44Q5JSH3 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
WDR44Q5JSH3 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
WDR44Q5JSH3 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
WDR44Q5JSH3 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
WDR44Q5JSH3 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
WDR44Q5JSH3 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
WDR44Q5JSH3 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
WDR44Q5JSH3 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
WDR44Q5JSH3 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
WDR44Q5JSH3 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
WDR44Q5JSH3 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
WDR44Q5JSH3 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
WDR44Q5JSH3 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
WDR44Q5JSH3 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
WDR44Q5JSH3 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
WDR44Q5JSH3 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
WDR44Q5JSH3 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
WDR44Q5JSH3 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
WDR44Q5JSH3 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
WDR44Q5JSH3 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
WDR44Q5JSH3 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
WDR44Q5JSH3 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
WDR44Q5JSH3 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
WDR44Q5JSH3 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
WDR44Q5JSH3 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
WDR44Q5JSH3 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
WDR44Q5JSH3 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
WDR44Q5JSH3 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
WDR44Q5JSH3 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms