Protein–RNA interactions for Protein: Q17RS7

GEN1, Flap endonuclease GEN homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 908 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GEN1Q17RS7 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
GEN1Q17RS7 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
GEN1Q17RS7 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
GEN1Q17RS7 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
GEN1Q17RS7 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
GEN1Q17RS7 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
GEN1Q17RS7 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
GEN1Q17RS7 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
GEN1Q17RS7 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
GEN1Q17RS7 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
GEN1Q17RS7 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
GEN1Q17RS7 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
GEN1Q17RS7 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
GEN1Q17RS7 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
GEN1Q17RS7 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
GEN1Q17RS7 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
GEN1Q17RS7 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
GEN1Q17RS7 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
GEN1Q17RS7 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
GEN1Q17RS7 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
GEN1Q17RS7 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
GEN1Q17RS7 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
GEN1Q17RS7 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
GEN1Q17RS7 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
GEN1Q17RS7 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
GEN1Q17RS7 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
GEN1Q17RS7 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
GEN1Q17RS7 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
GEN1Q17RS7 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
GEN1Q17RS7 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
GEN1Q17RS7 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
GEN1Q17RS7 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
GEN1Q17RS7 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
GEN1Q17RS7 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
GEN1Q17RS7 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.69
GEN1Q17RS7 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
GEN1Q17RS7 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
GEN1Q17RS7 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
GEN1Q17RS7 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
GEN1Q17RS7 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
GEN1Q17RS7 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
GEN1Q17RS7 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
GEN1Q17RS7 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
GEN1Q17RS7 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
GEN1Q17RS7 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
GEN1Q17RS7 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.68
GEN1Q17RS7 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
GEN1Q17RS7 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
GEN1Q17RS7 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC19.33■□□□□ 0.68
GEN1Q17RS7 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
GEN1Q17RS7 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
GEN1Q17RS7 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
GEN1Q17RS7 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
GEN1Q17RS7 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
GEN1Q17RS7 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
GEN1Q17RS7 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
GEN1Q17RS7 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
GEN1Q17RS7 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
GEN1Q17RS7 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
GEN1Q17RS7 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
GEN1Q17RS7 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
GEN1Q17RS7 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
GEN1Q17RS7 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
GEN1Q17RS7 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
GEN1Q17RS7 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
GEN1Q17RS7 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
GEN1Q17RS7 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
GEN1Q17RS7 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
GEN1Q17RS7 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
GEN1Q17RS7 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
GEN1Q17RS7 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
GEN1Q17RS7 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
GEN1Q17RS7 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
GEN1Q17RS7 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
GEN1Q17RS7 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
GEN1Q17RS7 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
GEN1Q17RS7 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
GEN1Q17RS7 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
GEN1Q17RS7 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
GEN1Q17RS7 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
GEN1Q17RS7 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
GEN1Q17RS7 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
GEN1Q17RS7 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
GEN1Q17RS7 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
GEN1Q17RS7 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
GEN1Q17RS7 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
GEN1Q17RS7 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
GEN1Q17RS7 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
GEN1Q17RS7 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
GEN1Q17RS7 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
GEN1Q17RS7 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
GEN1Q17RS7 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
GEN1Q17RS7 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
GEN1Q17RS7 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
GEN1Q17RS7 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
GEN1Q17RS7 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
GEN1Q17RS7 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
GEN1Q17RS7 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
GEN1Q17RS7 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
GEN1Q17RS7 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.7 ms