Protein–RNA interactions for Protein: Q16563

SYPL1, Synaptophysin-like protein 1, humanhuman

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Length 259 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYPL1Q16563 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SYPL1Q16563 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SYPL1Q16563 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SYPL1Q16563 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
SYPL1Q16563 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SYPL1Q16563 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SYPL1Q16563 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SYPL1Q16563 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SYPL1Q16563 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SYPL1Q16563 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SYPL1Q16563 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SYPL1Q16563 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SYPL1Q16563 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SYPL1Q16563 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SYPL1Q16563 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SYPL1Q16563 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SYPL1Q16563 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SYPL1Q16563 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SYPL1Q16563 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SYPL1Q16563 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SYPL1Q16563 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SYPL1Q16563 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SYPL1Q16563 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SYPL1Q16563 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SYPL1Q16563 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SYPL1Q16563 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SYPL1Q16563 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SYPL1Q16563 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SYPL1Q16563 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SYPL1Q16563 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
SYPL1Q16563 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SYPL1Q16563 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
SYPL1Q16563 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SYPL1Q16563 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SYPL1Q16563 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SYPL1Q16563 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SYPL1Q16563 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SYPL1Q16563 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SYPL1Q16563 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SYPL1Q16563 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SYPL1Q16563 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SYPL1Q16563 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SYPL1Q16563 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SYPL1Q16563 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SYPL1Q16563 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SYPL1Q16563 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SYPL1Q16563 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SYPL1Q16563 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SYPL1Q16563 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SYPL1Q16563 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
SYPL1Q16563 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SYPL1Q16563 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SYPL1Q16563 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
SYPL1Q16563 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
SYPL1Q16563 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SYPL1Q16563 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
SYPL1Q16563 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SYPL1Q16563 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SYPL1Q16563 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SYPL1Q16563 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SYPL1Q16563 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SYPL1Q16563 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SYPL1Q16563 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
SYPL1Q16563 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SYPL1Q16563 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SYPL1Q16563 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
SYPL1Q16563 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SYPL1Q16563 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SYPL1Q16563 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SYPL1Q16563 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SYPL1Q16563 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SYPL1Q16563 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SYPL1Q16563 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SYPL1Q16563 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SYPL1Q16563 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SYPL1Q16563 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SYPL1Q16563 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SYPL1Q16563 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SYPL1Q16563 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SYPL1Q16563 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SYPL1Q16563 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SYPL1Q16563 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SYPL1Q16563 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SYPL1Q16563 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
SYPL1Q16563 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SYPL1Q16563 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SYPL1Q16563 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SYPL1Q16563 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SYPL1Q16563 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
SYPL1Q16563 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SYPL1Q16563 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
SYPL1Q16563 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SYPL1Q16563 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SYPL1Q16563 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SYPL1Q16563 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SYPL1Q16563 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SYPL1Q16563 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SYPL1Q16563 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
SYPL1Q16563 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SYPL1Q16563 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
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