Protein–RNA interactions for Protein: Q16518

RPE65, Retinoid isomerohydrolase, humanhuman

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Length 533 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPE65Q16518 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RPE65Q16518 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
RPE65Q16518 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.49
RPE65Q16518 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
RPE65Q16518 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
RPE65Q16518 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
RPE65Q16518 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
RPE65Q16518 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
RPE65Q16518 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
RPE65Q16518 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
RPE65Q16518 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
RPE65Q16518 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
RPE65Q16518 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
RPE65Q16518 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RPE65Q16518 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RPE65Q16518 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RPE65Q16518 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RPE65Q16518 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RPE65Q16518 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RPE65Q16518 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
RPE65Q16518 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RPE65Q16518 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RPE65Q16518 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RPE65Q16518 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RPE65Q16518 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RPE65Q16518 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RPE65Q16518 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RPE65Q16518 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RPE65Q16518 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RPE65Q16518 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RPE65Q16518 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RPE65Q16518 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RPE65Q16518 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RPE65Q16518 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RPE65Q16518 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RPE65Q16518 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RPE65Q16518 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RPE65Q16518 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RPE65Q16518 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RPE65Q16518 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RPE65Q16518 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RPE65Q16518 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RPE65Q16518 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RPE65Q16518 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RPE65Q16518 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RPE65Q16518 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RPE65Q16518 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RPE65Q16518 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RPE65Q16518 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RPE65Q16518 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
RPE65Q16518 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RPE65Q16518 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RPE65Q16518 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RPE65Q16518 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RPE65Q16518 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RPE65Q16518 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RPE65Q16518 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RPE65Q16518 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RPE65Q16518 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RPE65Q16518 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RPE65Q16518 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RPE65Q16518 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RPE65Q16518 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RPE65Q16518 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RPE65Q16518 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RPE65Q16518 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RPE65Q16518 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RPE65Q16518 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RPE65Q16518 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RPE65Q16518 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RPE65Q16518 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RPE65Q16518 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RPE65Q16518 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RPE65Q16518 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RPE65Q16518 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RPE65Q16518 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
RPE65Q16518 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RPE65Q16518 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RPE65Q16518 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RPE65Q16518 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RPE65Q16518 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
RPE65Q16518 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RPE65Q16518 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RPE65Q16518 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RPE65Q16518 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RPE65Q16518 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RPE65Q16518 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RPE65Q16518 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RPE65Q16518 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RPE65Q16518 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RPE65Q16518 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
RPE65Q16518 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
RPE65Q16518 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RPE65Q16518 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RPE65Q16518 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RPE65Q16518 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RPE65Q16518 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RPE65Q16518 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RPE65Q16518 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RPE65Q16518 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
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