Protein–RNA interactions for Protein: Q15906

VPS72, Vacuolar protein sorting-associated protein 72 homolog, humanhuman

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Length 364 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS72Q15906 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC24.42■■□□□ 1.5
VPS72Q15906 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
VPS72Q15906 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
VPS72Q15906 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
VPS72Q15906 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
VPS72Q15906 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
VPS72Q15906 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
VPS72Q15906 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
VPS72Q15906 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
VPS72Q15906 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
VPS72Q15906 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
VPS72Q15906 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
VPS72Q15906 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
VPS72Q15906 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
VPS72Q15906 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
VPS72Q15906 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
VPS72Q15906 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
VPS72Q15906 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
VPS72Q15906 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
VPS72Q15906 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
VPS72Q15906 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
VPS72Q15906 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
VPS72Q15906 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
VPS72Q15906 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
VPS72Q15906 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
VPS72Q15906 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
VPS72Q15906 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
VPS72Q15906 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
VPS72Q15906 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
VPS72Q15906 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
VPS72Q15906 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
VPS72Q15906 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
VPS72Q15906 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
VPS72Q15906 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
VPS72Q15906 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
VPS72Q15906 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
VPS72Q15906 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
VPS72Q15906 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
VPS72Q15906 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
VPS72Q15906 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
VPS72Q15906 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC24.4■■□□□ 1.5
VPS72Q15906 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
VPS72Q15906 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
VPS72Q15906 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
VPS72Q15906 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
VPS72Q15906 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
VPS72Q15906 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
VPS72Q15906 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
VPS72Q15906 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
VPS72Q15906 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
VPS72Q15906 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
VPS72Q15906 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
VPS72Q15906 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
VPS72Q15906 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
VPS72Q15906 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
VPS72Q15906 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.5
VPS72Q15906 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
VPS72Q15906 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
VPS72Q15906 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
VPS72Q15906 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
VPS72Q15906 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
VPS72Q15906 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
VPS72Q15906 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
VPS72Q15906 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
VPS72Q15906 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
VPS72Q15906 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
VPS72Q15906 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
VPS72Q15906 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
VPS72Q15906 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
VPS72Q15906 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
VPS72Q15906 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
VPS72Q15906 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
VPS72Q15906 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
VPS72Q15906 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
VPS72Q15906 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
VPS72Q15906 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
VPS72Q15906 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
VPS72Q15906 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
VPS72Q15906 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
VPS72Q15906 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
VPS72Q15906 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
VPS72Q15906 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
VPS72Q15906 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
VPS72Q15906 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
VPS72Q15906 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
VPS72Q15906 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
VPS72Q15906 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
VPS72Q15906 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
VPS72Q15906 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
VPS72Q15906 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
VPS72Q15906 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
VPS72Q15906 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
VPS72Q15906 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
VPS72Q15906 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
VPS72Q15906 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
VPS72Q15906 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
VPS72Q15906 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
VPS72Q15906 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
VPS72Q15906 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
VPS72Q15906 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
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