Protein–RNA interactions for Protein: Q15011

HERPUD1, Homocysteine-responsive endoplasmic reticulum-resident ubiquitin-like domain member 1 protein, humanhuman

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Length 391 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERPUD1Q15011 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
HERPUD1Q15011 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
HERPUD1Q15011 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
HERPUD1Q15011 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
HERPUD1Q15011 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
HERPUD1Q15011 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
HERPUD1Q15011 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
HERPUD1Q15011 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
HERPUD1Q15011 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
HERPUD1Q15011 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
HERPUD1Q15011 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
HERPUD1Q15011 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
HERPUD1Q15011 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
HERPUD1Q15011 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
HERPUD1Q15011 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
HERPUD1Q15011 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
HERPUD1Q15011 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
HERPUD1Q15011 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
HERPUD1Q15011 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
HERPUD1Q15011 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
HERPUD1Q15011 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
HERPUD1Q15011 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
HERPUD1Q15011 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
HERPUD1Q15011 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
HERPUD1Q15011 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
HERPUD1Q15011 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
HERPUD1Q15011 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
HERPUD1Q15011 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
HERPUD1Q15011 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
HERPUD1Q15011 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
HERPUD1Q15011 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
HERPUD1Q15011 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
HERPUD1Q15011 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
HERPUD1Q15011 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
HERPUD1Q15011 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
HERPUD1Q15011 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
HERPUD1Q15011 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
HERPUD1Q15011 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
HERPUD1Q15011 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
HERPUD1Q15011 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
HERPUD1Q15011 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
HERPUD1Q15011 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
HERPUD1Q15011 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
HERPUD1Q15011 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
HERPUD1Q15011 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
HERPUD1Q15011 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
HERPUD1Q15011 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
HERPUD1Q15011 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
HERPUD1Q15011 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
HERPUD1Q15011 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
HERPUD1Q15011 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
HERPUD1Q15011 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
HERPUD1Q15011 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
HERPUD1Q15011 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
HERPUD1Q15011 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
HERPUD1Q15011 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
HERPUD1Q15011 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
HERPUD1Q15011 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
HERPUD1Q15011 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
HERPUD1Q15011 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
HERPUD1Q15011 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
HERPUD1Q15011 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
HERPUD1Q15011 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
HERPUD1Q15011 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
HERPUD1Q15011 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
HERPUD1Q15011 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
HERPUD1Q15011 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
HERPUD1Q15011 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
HERPUD1Q15011 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
HERPUD1Q15011 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
HERPUD1Q15011 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
HERPUD1Q15011 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
HERPUD1Q15011 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
HERPUD1Q15011 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
HERPUD1Q15011 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
HERPUD1Q15011 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
HERPUD1Q15011 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
HERPUD1Q15011 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
HERPUD1Q15011 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
HERPUD1Q15011 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
HERPUD1Q15011 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
HERPUD1Q15011 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
HERPUD1Q15011 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
HERPUD1Q15011 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
HERPUD1Q15011 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
HERPUD1Q15011 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
HERPUD1Q15011 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
HERPUD1Q15011 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
HERPUD1Q15011 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
HERPUD1Q15011 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
HERPUD1Q15011 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
HERPUD1Q15011 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
HERPUD1Q15011 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
HERPUD1Q15011 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
HERPUD1Q15011 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
HERPUD1Q15011 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
HERPUD1Q15011 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
HERPUD1Q15011 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
HERPUD1Q15011 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
HERPUD1Q15011 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
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