Protein–RNA interactions for Protein: Q13618

CUL3, Cullin-3, humanhuman

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Length 768 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL3Q13618 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CUL3Q13618 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CUL3Q13618 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CUL3Q13618 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CUL3Q13618 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CUL3Q13618 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CUL3Q13618 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CUL3Q13618 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CUL3Q13618 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CUL3Q13618 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CUL3Q13618 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
CUL3Q13618 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
CUL3Q13618 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.55
CUL3Q13618 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CUL3Q13618 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CUL3Q13618 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
CUL3Q13618 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CUL3Q13618 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CUL3Q13618 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CUL3Q13618 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CUL3Q13618 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CUL3Q13618 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CUL3Q13618 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CUL3Q13618 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CUL3Q13618 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CUL3Q13618 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CUL3Q13618 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CUL3Q13618 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CUL3Q13618 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CUL3Q13618 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CUL3Q13618 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CUL3Q13618 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CUL3Q13618 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CUL3Q13618 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CUL3Q13618 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CUL3Q13618 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CUL3Q13618 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CUL3Q13618 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CUL3Q13618 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CUL3Q13618 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CUL3Q13618 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CUL3Q13618 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CUL3Q13618 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CUL3Q13618 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CUL3Q13618 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CUL3Q13618 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CUL3Q13618 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CUL3Q13618 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CUL3Q13618 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CUL3Q13618 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CUL3Q13618 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CUL3Q13618 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CUL3Q13618 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CUL3Q13618 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
CUL3Q13618 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CUL3Q13618 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CUL3Q13618 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CUL3Q13618 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CUL3Q13618 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CUL3Q13618 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CUL3Q13618 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CUL3Q13618 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CUL3Q13618 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CUL3Q13618 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CUL3Q13618 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CUL3Q13618 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CUL3Q13618 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CUL3Q13618 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CUL3Q13618 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CUL3Q13618 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CUL3Q13618 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CUL3Q13618 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CUL3Q13618 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CUL3Q13618 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CUL3Q13618 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CUL3Q13618 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CUL3Q13618 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CUL3Q13618 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CUL3Q13618 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CUL3Q13618 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CUL3Q13618 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CUL3Q13618 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CUL3Q13618 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CUL3Q13618 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CUL3Q13618 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CUL3Q13618 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CUL3Q13618 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CUL3Q13618 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
CUL3Q13618 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CUL3Q13618 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CUL3Q13618 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CUL3Q13618 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CUL3Q13618 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CUL3Q13618 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
CUL3Q13618 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CUL3Q13618 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CUL3Q13618 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
CUL3Q13618 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CUL3Q13618 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CUL3Q13618 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
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