Protein–RNA interactions for Protein: Q13506

NAB1, NGFI-A-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 487 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NAB1Q13506 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
NAB1Q13506 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
NAB1Q13506 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
NAB1Q13506 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
NAB1Q13506 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
NAB1Q13506 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
NAB1Q13506 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
NAB1Q13506 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
NAB1Q13506 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
NAB1Q13506 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
NAB1Q13506 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
NAB1Q13506 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
NAB1Q13506 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
NAB1Q13506 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
NAB1Q13506 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
NAB1Q13506 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
NAB1Q13506 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
NAB1Q13506 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
NAB1Q13506 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
NAB1Q13506 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
NAB1Q13506 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
NAB1Q13506 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
NAB1Q13506 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
NAB1Q13506 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
NAB1Q13506 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
NAB1Q13506 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.58
NAB1Q13506 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
NAB1Q13506 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
NAB1Q13506 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
NAB1Q13506 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
NAB1Q13506 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
NAB1Q13506 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
NAB1Q13506 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
NAB1Q13506 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
NAB1Q13506 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
NAB1Q13506 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
NAB1Q13506 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC18.64■□□□□ 0.57
NAB1Q13506 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
NAB1Q13506 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
NAB1Q13506 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
NAB1Q13506 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
NAB1Q13506 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
NAB1Q13506 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
NAB1Q13506 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
NAB1Q13506 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
NAB1Q13506 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
NAB1Q13506 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
NAB1Q13506 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
NAB1Q13506 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
NAB1Q13506 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
NAB1Q13506 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
NAB1Q13506 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
NAB1Q13506 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
NAB1Q13506 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
NAB1Q13506 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
NAB1Q13506 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
NAB1Q13506 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
NAB1Q13506 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
NAB1Q13506 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
NAB1Q13506 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
NAB1Q13506 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
NAB1Q13506 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
NAB1Q13506 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
NAB1Q13506 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
NAB1Q13506 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
NAB1Q13506 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
NAB1Q13506 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
NAB1Q13506 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
NAB1Q13506 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
NAB1Q13506 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC18.63■□□□□ 0.57
NAB1Q13506 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
NAB1Q13506 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
NAB1Q13506 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
NAB1Q13506 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
NAB1Q13506 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
NAB1Q13506 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
NAB1Q13506 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
NAB1Q13506 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
NAB1Q13506 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
NAB1Q13506 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
NAB1Q13506 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
NAB1Q13506 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
NAB1Q13506 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
NAB1Q13506 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
NAB1Q13506 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
NAB1Q13506 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
NAB1Q13506 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
NAB1Q13506 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
NAB1Q13506 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
NAB1Q13506 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
NAB1Q13506 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC18.62■□□□□ 0.57
NAB1Q13506 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
NAB1Q13506 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
NAB1Q13506 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC18.62■□□□□ 0.57
NAB1Q13506 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
NAB1Q13506 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
NAB1Q13506 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
NAB1Q13506 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
NAB1Q13506 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
NAB1Q13506 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.7 ms