Protein–RNA interactions for Protein: Q13342

SP140, Nuclear body protein SP140, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP140Q13342 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SP140Q13342 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SP140Q13342 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SP140Q13342 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SP140Q13342 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SP140Q13342 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SP140Q13342 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
SP140Q13342 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
SP140Q13342 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SP140Q13342 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SP140Q13342 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SP140Q13342 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SP140Q13342 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SP140Q13342 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SP140Q13342 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
SP140Q13342 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SP140Q13342 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SP140Q13342 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SP140Q13342 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SP140Q13342 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SP140Q13342 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SP140Q13342 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SP140Q13342 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SP140Q13342 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
SP140Q13342 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
SP140Q13342 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SP140Q13342 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SP140Q13342 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SP140Q13342 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
SP140Q13342 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SP140Q13342 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SP140Q13342 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SP140Q13342 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SP140Q13342 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SP140Q13342 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SP140Q13342 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SP140Q13342 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SP140Q13342 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SP140Q13342 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
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SP140Q13342 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SP140Q13342 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SP140Q13342 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SP140Q13342 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SP140Q13342 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
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SP140Q13342 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SP140Q13342 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SP140Q13342 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SP140Q13342 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SP140Q13342 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
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SP140Q13342 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SP140Q13342 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
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SP140Q13342 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SP140Q13342 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SP140Q13342 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SP140Q13342 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SP140Q13342 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
SP140Q13342 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
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SP140Q13342 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
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SP140Q13342 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
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SP140Q13342 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
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SP140Q13342 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SP140Q13342 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SP140Q13342 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SP140Q13342 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SP140Q13342 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SP140Q13342 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SP140Q13342 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SP140Q13342 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SP140Q13342 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SP140Q13342 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SP140Q13342 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SP140Q13342 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
SP140Q13342 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SP140Q13342 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SP140Q13342 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SP140Q13342 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SP140Q13342 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SP140Q13342 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SP140Q13342 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SP140Q13342 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SP140Q13342 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SP140Q13342 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
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