Protein–RNA interactions for Protein: Q13156

RPA4, Replication protein A 30 kDa subunit, humanhuman

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Length 261 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPA4Q13156 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RPA4Q13156 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RPA4Q13156 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
RPA4Q13156 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RPA4Q13156 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
RPA4Q13156 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RPA4Q13156 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RPA4Q13156 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RPA4Q13156 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RPA4Q13156 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RPA4Q13156 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RPA4Q13156 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RPA4Q13156 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RPA4Q13156 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RPA4Q13156 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RPA4Q13156 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RPA4Q13156 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RPA4Q13156 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RPA4Q13156 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RPA4Q13156 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RPA4Q13156 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RPA4Q13156 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RPA4Q13156 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RPA4Q13156 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
RPA4Q13156 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RPA4Q13156 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
RPA4Q13156 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
RPA4Q13156 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RPA4Q13156 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RPA4Q13156 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
RPA4Q13156 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RPA4Q13156 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RPA4Q13156 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RPA4Q13156 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RPA4Q13156 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RPA4Q13156 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RPA4Q13156 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RPA4Q13156 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RPA4Q13156 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RPA4Q13156 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RPA4Q13156 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RPA4Q13156 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RPA4Q13156 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
RPA4Q13156 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RPA4Q13156 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RPA4Q13156 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RPA4Q13156 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RPA4Q13156 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RPA4Q13156 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RPA4Q13156 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
RPA4Q13156 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RPA4Q13156 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RPA4Q13156 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RPA4Q13156 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RPA4Q13156 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RPA4Q13156 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RPA4Q13156 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
RPA4Q13156 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RPA4Q13156 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RPA4Q13156 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RPA4Q13156 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RPA4Q13156 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RPA4Q13156 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
RPA4Q13156 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RPA4Q13156 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RPA4Q13156 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RPA4Q13156 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RPA4Q13156 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RPA4Q13156 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RPA4Q13156 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RPA4Q13156 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RPA4Q13156 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RPA4Q13156 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RPA4Q13156 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RPA4Q13156 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RPA4Q13156 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RPA4Q13156 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RPA4Q13156 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RPA4Q13156 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RPA4Q13156 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
RPA4Q13156 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RPA4Q13156 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RPA4Q13156 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
RPA4Q13156 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RPA4Q13156 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
RPA4Q13156 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RPA4Q13156 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RPA4Q13156 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
RPA4Q13156 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RPA4Q13156 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RPA4Q13156 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
RPA4Q13156 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
RPA4Q13156 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RPA4Q13156 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RPA4Q13156 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RPA4Q13156 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RPA4Q13156 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RPA4Q13156 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RPA4Q13156 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RPA4Q13156 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
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