Protein–RNA interactions for Protein: Q12980

NPRL3, GATOR complex protein NPRL3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPRL3Q12980 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NPRL3Q12980 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NPRL3Q12980 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
NPRL3Q12980 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
NPRL3Q12980 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
NPRL3Q12980 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
NPRL3Q12980 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
NPRL3Q12980 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
NPRL3Q12980 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
NPRL3Q12980 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
NPRL3Q12980 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
NPRL3Q12980 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
NPRL3Q12980 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
NPRL3Q12980 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
NPRL3Q12980 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
NPRL3Q12980 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
NPRL3Q12980 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
NPRL3Q12980 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
NPRL3Q12980 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
NPRL3Q12980 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
NPRL3Q12980 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
NPRL3Q12980 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
NPRL3Q12980 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
NPRL3Q12980 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
NPRL3Q12980 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
NPRL3Q12980 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
NPRL3Q12980 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
NPRL3Q12980 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
NPRL3Q12980 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
NPRL3Q12980 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
NPRL3Q12980 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
NPRL3Q12980 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
NPRL3Q12980 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
NPRL3Q12980 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
NPRL3Q12980 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
NPRL3Q12980 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
NPRL3Q12980 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
NPRL3Q12980 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
NPRL3Q12980 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
NPRL3Q12980 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NPRL3Q12980 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NPRL3Q12980 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
NPRL3Q12980 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NPRL3Q12980 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
NPRL3Q12980 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NPRL3Q12980 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
NPRL3Q12980 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NPRL3Q12980 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
NPRL3Q12980 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NPRL3Q12980 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NPRL3Q12980 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
NPRL3Q12980 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NPRL3Q12980 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
NPRL3Q12980 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NPRL3Q12980 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
NPRL3Q12980 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NPRL3Q12980 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NPRL3Q12980 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NPRL3Q12980 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NPRL3Q12980 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
NPRL3Q12980 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
NPRL3Q12980 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
NPRL3Q12980 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
NPRL3Q12980 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
NPRL3Q12980 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NPRL3Q12980 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
NPRL3Q12980 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
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NPRL3Q12980 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NPRL3Q12980 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
NPRL3Q12980 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NPRL3Q12980 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
NPRL3Q12980 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NPRL3Q12980 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NPRL3Q12980 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
NPRL3Q12980 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NPRL3Q12980 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NPRL3Q12980 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NPRL3Q12980 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NPRL3Q12980 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NPRL3Q12980 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NPRL3Q12980 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NPRL3Q12980 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NPRL3Q12980 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NPRL3Q12980 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NPRL3Q12980 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NPRL3Q12980 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NPRL3Q12980 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NPRL3Q12980 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NPRL3Q12980 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
NPRL3Q12980 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NPRL3Q12980 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
NPRL3Q12980 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NPRL3Q12980 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NPRL3Q12980 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NPRL3Q12980 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NPRL3Q12980 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NPRL3Q12980 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NPRL3Q12980 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NPRL3Q12980 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
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