Protein–RNA interactions for Protein: Q05209

PTPN12, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 780 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN12Q05209 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PTPN12Q05209 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PTPN12Q05209 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PTPN12Q05209 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PTPN12Q05209 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PTPN12Q05209 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PTPN12Q05209 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PTPN12Q05209 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PTPN12Q05209 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PTPN12Q05209 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
PTPN12Q05209 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PTPN12Q05209 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PTPN12Q05209 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PTPN12Q05209 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PTPN12Q05209 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PTPN12Q05209 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PTPN12Q05209 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
PTPN12Q05209 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PTPN12Q05209 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PTPN12Q05209 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PTPN12Q05209 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PTPN12Q05209 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PTPN12Q05209 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PTPN12Q05209 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PTPN12Q05209 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PTPN12Q05209 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PTPN12Q05209 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PTPN12Q05209 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PTPN12Q05209 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PTPN12Q05209 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PTPN12Q05209 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
PTPN12Q05209 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PTPN12Q05209 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PTPN12Q05209 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PTPN12Q05209 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
PTPN12Q05209 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
PTPN12Q05209 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PTPN12Q05209 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PTPN12Q05209 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PTPN12Q05209 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PTPN12Q05209 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PTPN12Q05209 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PTPN12Q05209 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PTPN12Q05209 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PTPN12Q05209 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PTPN12Q05209 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PTPN12Q05209 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PTPN12Q05209 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
PTPN12Q05209 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PTPN12Q05209 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PTPN12Q05209 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PTPN12Q05209 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PTPN12Q05209 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PTPN12Q05209 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PTPN12Q05209 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PTPN12Q05209 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PTPN12Q05209 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PTPN12Q05209 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PTPN12Q05209 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PTPN12Q05209 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PTPN12Q05209 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PTPN12Q05209 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PTPN12Q05209 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PTPN12Q05209 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PTPN12Q05209 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PTPN12Q05209 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PTPN12Q05209 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PTPN12Q05209 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PTPN12Q05209 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PTPN12Q05209 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PTPN12Q05209 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PTPN12Q05209 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PTPN12Q05209 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PTPN12Q05209 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PTPN12Q05209 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PTPN12Q05209 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PTPN12Q05209 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PTPN12Q05209 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PTPN12Q05209 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PTPN12Q05209 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PTPN12Q05209 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PTPN12Q05209 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PTPN12Q05209 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PTPN12Q05209 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
PTPN12Q05209 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
PTPN12Q05209 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PTPN12Q05209 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PTPN12Q05209 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
PTPN12Q05209 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PTPN12Q05209 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PTPN12Q05209 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PTPN12Q05209 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PTPN12Q05209 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PTPN12Q05209 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PTPN12Q05209 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PTPN12Q05209 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PTPN12Q05209 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PTPN12Q05209 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PTPN12Q05209 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PTPN12Q05209 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.1 ms