Protein–RNA interactions for Protein: Q02577

NHLH2, Helix-loop-helix protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NHLH2Q02577 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NHLH2Q02577 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NHLH2Q02577 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NHLH2Q02577 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NHLH2Q02577 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NHLH2Q02577 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NHLH2Q02577 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NHLH2Q02577 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NHLH2Q02577 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NHLH2Q02577 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NHLH2Q02577 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NHLH2Q02577 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NHLH2Q02577 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NHLH2Q02577 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NHLH2Q02577 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NHLH2Q02577 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NHLH2Q02577 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NHLH2Q02577 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NHLH2Q02577 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NHLH2Q02577 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NHLH2Q02577 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NHLH2Q02577 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NHLH2Q02577 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NHLH2Q02577 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NHLH2Q02577 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NHLH2Q02577 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
NHLH2Q02577 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NHLH2Q02577 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NHLH2Q02577 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NHLH2Q02577 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NHLH2Q02577 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NHLH2Q02577 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NHLH2Q02577 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NHLH2Q02577 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NHLH2Q02577 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NHLH2Q02577 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
NHLH2Q02577 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NHLH2Q02577 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NHLH2Q02577 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NHLH2Q02577 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NHLH2Q02577 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NHLH2Q02577 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NHLH2Q02577 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NHLH2Q02577 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NHLH2Q02577 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NHLH2Q02577 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NHLH2Q02577 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NHLH2Q02577 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NHLH2Q02577 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NHLH2Q02577 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NHLH2Q02577 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NHLH2Q02577 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NHLH2Q02577 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NHLH2Q02577 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NHLH2Q02577 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NHLH2Q02577 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NHLH2Q02577 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NHLH2Q02577 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NHLH2Q02577 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NHLH2Q02577 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NHLH2Q02577 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
NHLH2Q02577 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NHLH2Q02577 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NHLH2Q02577 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NHLH2Q02577 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NHLH2Q02577 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NHLH2Q02577 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NHLH2Q02577 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NHLH2Q02577 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NHLH2Q02577 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NHLH2Q02577 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
NHLH2Q02577 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NHLH2Q02577 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NHLH2Q02577 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NHLH2Q02577 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NHLH2Q02577 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
NHLH2Q02577 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NHLH2Q02577 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NHLH2Q02577 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NHLH2Q02577 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NHLH2Q02577 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NHLH2Q02577 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NHLH2Q02577 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NHLH2Q02577 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NHLH2Q02577 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NHLH2Q02577 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NHLH2Q02577 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NHLH2Q02577 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NHLH2Q02577 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NHLH2Q02577 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NHLH2Q02577 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NHLH2Q02577 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NHLH2Q02577 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NHLH2Q02577 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NHLH2Q02577 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NHLH2Q02577 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NHLH2Q02577 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NHLH2Q02577 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NHLH2Q02577 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NHLH2Q02577 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms