Protein–RNA interactions for Protein: Q00536

CDK16, Cyclin-dependent kinase 16, humanhuman

Predictions only

Length 496 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK16Q00536 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
CDK16Q00536 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CDK16Q00536 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CDK16Q00536 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CDK16Q00536 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CDK16Q00536 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CDK16Q00536 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC19■□□□□ 0.63
CDK16Q00536 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CDK16Q00536 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CDK16Q00536 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
CDK16Q00536 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CDK16Q00536 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
CDK16Q00536 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CDK16Q00536 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CDK16Q00536 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC19■□□□□ 0.63
CDK16Q00536 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CDK16Q00536 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC19■□□□□ 0.63
CDK16Q00536 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
CDK16Q00536 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CDK16Q00536 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CDK16Q00536 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CDK16Q00536 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CDK16Q00536 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CDK16Q00536 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CDK16Q00536 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CDK16Q00536 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CDK16Q00536 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CDK16Q00536 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CDK16Q00536 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CDK16Q00536 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CDK16Q00536 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CDK16Q00536 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CDK16Q00536 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CDK16Q00536 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CDK16Q00536 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CDK16Q00536 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CDK16Q00536 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CDK16Q00536 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CDK16Q00536 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CDK16Q00536 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CDK16Q00536 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CDK16Q00536 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CDK16Q00536 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CDK16Q00536 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CDK16Q00536 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CDK16Q00536 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CDK16Q00536 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CDK16Q00536 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
CDK16Q00536 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CDK16Q00536 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CDK16Q00536 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CDK16Q00536 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CDK16Q00536 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CDK16Q00536 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CDK16Q00536 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CDK16Q00536 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CDK16Q00536 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CDK16Q00536 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
CDK16Q00536 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CDK16Q00536 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CDK16Q00536 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CDK16Q00536 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CDK16Q00536 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CDK16Q00536 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CDK16Q00536 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
CDK16Q00536 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
CDK16Q00536 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CDK16Q00536 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CDK16Q00536 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CDK16Q00536 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CDK16Q00536 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
CDK16Q00536 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CDK16Q00536 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CDK16Q00536 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CDK16Q00536 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CDK16Q00536 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CDK16Q00536 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CDK16Q00536 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CDK16Q00536 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CDK16Q00536 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CDK16Q00536 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CDK16Q00536 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CDK16Q00536 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CDK16Q00536 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CDK16Q00536 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CDK16Q00536 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CDK16Q00536 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CDK16Q00536 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CDK16Q00536 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CDK16Q00536 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CDK16Q00536 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CDK16Q00536 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CDK16Q00536 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CDK16Q00536 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CDK16Q00536 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CDK16Q00536 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CDK16Q00536 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CDK16Q00536 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CDK16Q00536 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CDK16Q00536 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms