Protein–RNA interactions for Protein: P78556

CCL20, C-C motif chemokine 20, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL20P78556 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CCL20P78556 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CCL20P78556 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CCL20P78556 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
CCL20P78556 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CCL20P78556 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CCL20P78556 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CCL20P78556 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CCL20P78556 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CCL20P78556 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CCL20P78556 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CCL20P78556 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CCL20P78556 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CCL20P78556 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CCL20P78556 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CCL20P78556 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CCL20P78556 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CCL20P78556 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CCL20P78556 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CCL20P78556 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CCL20P78556 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CCL20P78556 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CCL20P78556 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CCL20P78556 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CCL20P78556 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CCL20P78556 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CCL20P78556 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CCL20P78556 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CCL20P78556 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CCL20P78556 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CCL20P78556 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CCL20P78556 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CCL20P78556 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CCL20P78556 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CCL20P78556 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CCL20P78556 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
CCL20P78556 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CCL20P78556 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CCL20P78556 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CCL20P78556 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CCL20P78556 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
CCL20P78556 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CCL20P78556 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CCL20P78556 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CCL20P78556 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CCL20P78556 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CCL20P78556 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CCL20P78556 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CCL20P78556 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CCL20P78556 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CCL20P78556 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CCL20P78556 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CCL20P78556 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CCL20P78556 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CCL20P78556 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CCL20P78556 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CCL20P78556 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CCL20P78556 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CCL20P78556 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CCL20P78556 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CCL20P78556 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CCL20P78556 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CCL20P78556 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CCL20P78556 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CCL20P78556 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
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CCL20P78556 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
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CCL20P78556 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CCL20P78556 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CCL20P78556 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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CCL20P78556 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CCL20P78556 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CCL20P78556 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CCL20P78556 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CCL20P78556 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
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CCL20P78556 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CCL20P78556 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CCL20P78556 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CCL20P78556 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CCL20P78556 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CCL20P78556 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CCL20P78556 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CCL20P78556 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CCL20P78556 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CCL20P78556 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CCL20P78556 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CCL20P78556 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CCL20P78556 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CCL20P78556 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CCL20P78556 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CCL20P78556 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CCL20P78556 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CCL20P78556 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CCL20P78556 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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