Protein–RNA interactions for Protein: P63132

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Pol protein, humanhuman

Predictions only

Length 956 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P63132 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HERVK_113P63132 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HERVK_113P63132 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HERVK_113P63132 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HERVK_113P63132 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HERVK_113P63132 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HERVK_113P63132 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HERVK_113P63132 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HERVK_113P63132 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HERVK_113P63132 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HERVK_113P63132 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HERVK_113P63132 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HERVK_113P63132 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HERVK_113P63132 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HERVK_113P63132 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HERVK_113P63132 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
HERVK_113P63132 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HERVK_113P63132 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HERVK_113P63132 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HERVK_113P63132 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
HERVK_113P63132 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HERVK_113P63132 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HERVK_113P63132 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
HERVK_113P63132 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HERVK_113P63132 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HERVK_113P63132 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HERVK_113P63132 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HERVK_113P63132 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HERVK_113P63132 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HERVK_113P63132 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HERVK_113P63132 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HERVK_113P63132 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HERVK_113P63132 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
HERVK_113P63132 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HERVK_113P63132 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HERVK_113P63132 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HERVK_113P63132 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HERVK_113P63132 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HERVK_113P63132 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HERVK_113P63132 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HERVK_113P63132 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HERVK_113P63132 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HERVK_113P63132 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HERVK_113P63132 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HERVK_113P63132 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HERVK_113P63132 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HERVK_113P63132 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HERVK_113P63132 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HERVK_113P63132 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HERVK_113P63132 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HERVK_113P63132 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HERVK_113P63132 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HERVK_113P63132 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HERVK_113P63132 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HERVK_113P63132 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HERVK_113P63132 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HERVK_113P63132 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HERVK_113P63132 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HERVK_113P63132 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HERVK_113P63132 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HERVK_113P63132 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HERVK_113P63132 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HERVK_113P63132 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HERVK_113P63132 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HERVK_113P63132 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HERVK_113P63132 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HERVK_113P63132 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HERVK_113P63132 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HERVK_113P63132 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HERVK_113P63132 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HERVK_113P63132 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HERVK_113P63132 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HERVK_113P63132 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HERVK_113P63132 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HERVK_113P63132 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HERVK_113P63132 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HERVK_113P63132 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HERVK_113P63132 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HERVK_113P63132 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HERVK_113P63132 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HERVK_113P63132 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HERVK_113P63132 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HERVK_113P63132 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HERVK_113P63132 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HERVK_113P63132 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HERVK_113P63132 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HERVK_113P63132 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HERVK_113P63132 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HERVK_113P63132 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
HERVK_113P63132 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HERVK_113P63132 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HERVK_113P63132 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HERVK_113P63132 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HERVK_113P63132 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HERVK_113P63132 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HERVK_113P63132 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HERVK_113P63132 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HERVK_113P63132 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HERVK_113P63132 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HERVK_113P63132 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms