Protein–RNA interactions for Protein: P51884

LUM, Lumican, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 338 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LUMP51884 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LUMP51884 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LUMP51884 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LUMP51884 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LUMP51884 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LUMP51884 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
LUMP51884 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LUMP51884 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LUMP51884 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LUMP51884 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
LUMP51884 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
LUMP51884 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LUMP51884 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LUMP51884 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LUMP51884 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LUMP51884 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LUMP51884 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LUMP51884 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LUMP51884 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LUMP51884 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LUMP51884 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LUMP51884 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LUMP51884 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LUMP51884 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LUMP51884 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LUMP51884 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LUMP51884 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LUMP51884 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LUMP51884 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LUMP51884 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LUMP51884 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LUMP51884 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LUMP51884 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LUMP51884 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
LUMP51884 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LUMP51884 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
LUMP51884 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LUMP51884 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LUMP51884 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LUMP51884 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LUMP51884 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LUMP51884 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LUMP51884 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LUMP51884 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LUMP51884 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LUMP51884 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LUMP51884 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LUMP51884 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LUMP51884 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LUMP51884 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LUMP51884 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LUMP51884 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LUMP51884 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LUMP51884 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LUMP51884 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LUMP51884 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LUMP51884 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LUMP51884 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LUMP51884 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LUMP51884 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LUMP51884 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LUMP51884 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LUMP51884 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LUMP51884 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LUMP51884 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LUMP51884 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LUMP51884 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LUMP51884 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LUMP51884 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LUMP51884 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LUMP51884 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
LUMP51884 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LUMP51884 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LUMP51884 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LUMP51884 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LUMP51884 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LUMP51884 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LUMP51884 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LUMP51884 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LUMP51884 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LUMP51884 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LUMP51884 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
LUMP51884 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LUMP51884 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LUMP51884 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
LUMP51884 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LUMP51884 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LUMP51884 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LUMP51884 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LUMP51884 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LUMP51884 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LUMP51884 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LUMP51884 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LUMP51884 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LUMP51884 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LUMP51884 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LUMP51884 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LUMP51884 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LUMP51884 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LUMP51884 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms