Protein–RNA interactions for Protein: P48729

CSNK1A1, Casein kinase I isoform alpha, humanhuman

Predictions only

Length 337 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK1A1P48729 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CSNK1A1P48729 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CSNK1A1P48729 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CSNK1A1P48729 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CSNK1A1P48729 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
CSNK1A1P48729 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CSNK1A1P48729 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CSNK1A1P48729 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CSNK1A1P48729 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CSNK1A1P48729 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CSNK1A1P48729 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CSNK1A1P48729 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CSNK1A1P48729 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CSNK1A1P48729 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CSNK1A1P48729 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CSNK1A1P48729 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CSNK1A1P48729 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CSNK1A1P48729 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
CSNK1A1P48729 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CSNK1A1P48729 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CSNK1A1P48729 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CSNK1A1P48729 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CSNK1A1P48729 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CSNK1A1P48729 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CSNK1A1P48729 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CSNK1A1P48729 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CSNK1A1P48729 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CSNK1A1P48729 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CSNK1A1P48729 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CSNK1A1P48729 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CSNK1A1P48729 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CSNK1A1P48729 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CSNK1A1P48729 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CSNK1A1P48729 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CSNK1A1P48729 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CSNK1A1P48729 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CSNK1A1P48729 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CSNK1A1P48729 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CSNK1A1P48729 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CSNK1A1P48729 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CSNK1A1P48729 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CSNK1A1P48729 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CSNK1A1P48729 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CSNK1A1P48729 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CSNK1A1P48729 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CSNK1A1P48729 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CSNK1A1P48729 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CSNK1A1P48729 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CSNK1A1P48729 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CSNK1A1P48729 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CSNK1A1P48729 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CSNK1A1P48729 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CSNK1A1P48729 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CSNK1A1P48729 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
CSNK1A1P48729 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CSNK1A1P48729 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CSNK1A1P48729 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CSNK1A1P48729 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CSNK1A1P48729 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CSNK1A1P48729 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CSNK1A1P48729 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CSNK1A1P48729 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CSNK1A1P48729 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CSNK1A1P48729 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CSNK1A1P48729 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CSNK1A1P48729 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CSNK1A1P48729 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CSNK1A1P48729 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CSNK1A1P48729 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CSNK1A1P48729 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CSNK1A1P48729 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CSNK1A1P48729 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CSNK1A1P48729 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CSNK1A1P48729 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CSNK1A1P48729 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CSNK1A1P48729 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CSNK1A1P48729 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CSNK1A1P48729 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CSNK1A1P48729 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CSNK1A1P48729 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CSNK1A1P48729 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CSNK1A1P48729 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CSNK1A1P48729 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CSNK1A1P48729 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CSNK1A1P48729 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CSNK1A1P48729 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CSNK1A1P48729 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CSNK1A1P48729 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CSNK1A1P48729 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CSNK1A1P48729 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CSNK1A1P48729 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CSNK1A1P48729 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CSNK1A1P48729 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CSNK1A1P48729 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CSNK1A1P48729 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CSNK1A1P48729 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CSNK1A1P48729 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CSNK1A1P48729 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CSNK1A1P48729 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CSNK1A1P48729 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms