Protein–RNA interactions for Protein: P48668

KRT6C, Keratin, type II cytoskeletal 6C, humanhuman

Predictions only

Length 564 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT6CP48668 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
KRT6CP48668 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
KRT6CP48668 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
KRT6CP48668 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
KRT6CP48668 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
KRT6CP48668 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
KRT6CP48668 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
KRT6CP48668 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
KRT6CP48668 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
KRT6CP48668 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
KRT6CP48668 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
KRT6CP48668 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
KRT6CP48668 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
KRT6CP48668 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
KRT6CP48668 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
KRT6CP48668 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
KRT6CP48668 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
KRT6CP48668 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
KRT6CP48668 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
KRT6CP48668 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
KRT6CP48668 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
KRT6CP48668 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
KRT6CP48668 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
KRT6CP48668 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
KRT6CP48668 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
KRT6CP48668 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
KRT6CP48668 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
KRT6CP48668 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
KRT6CP48668 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
KRT6CP48668 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
KRT6CP48668 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
KRT6CP48668 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC18.09■□□□□ 0.49
KRT6CP48668 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
KRT6CP48668 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
KRT6CP48668 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
KRT6CP48668 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
KRT6CP48668 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
KRT6CP48668 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
KRT6CP48668 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
KRT6CP48668 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
KRT6CP48668 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
KRT6CP48668 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
KRT6CP48668 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
KRT6CP48668 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
KRT6CP48668 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
KRT6CP48668 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
KRT6CP48668 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
KRT6CP48668 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
KRT6CP48668 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
KRT6CP48668 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
KRT6CP48668 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
KRT6CP48668 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
KRT6CP48668 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
KRT6CP48668 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
KRT6CP48668 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
KRT6CP48668 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
KRT6CP48668 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
KRT6CP48668 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
KRT6CP48668 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
KRT6CP48668 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
KRT6CP48668 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
KRT6CP48668 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
KRT6CP48668 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
KRT6CP48668 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
KRT6CP48668 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
KRT6CP48668 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
KRT6CP48668 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
KRT6CP48668 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
KRT6CP48668 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
KRT6CP48668 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
KRT6CP48668 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
KRT6CP48668 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
KRT6CP48668 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
KRT6CP48668 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
KRT6CP48668 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
KRT6CP48668 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
KRT6CP48668 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
KRT6CP48668 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
KRT6CP48668 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
KRT6CP48668 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
KRT6CP48668 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
KRT6CP48668 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
KRT6CP48668 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
KRT6CP48668 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
KRT6CP48668 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
KRT6CP48668 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
KRT6CP48668 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
KRT6CP48668 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
KRT6CP48668 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
KRT6CP48668 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
KRT6CP48668 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
KRT6CP48668 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
KRT6CP48668 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
KRT6CP48668 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
KRT6CP48668 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
KRT6CP48668 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
KRT6CP48668 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
KRT6CP48668 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
KRT6CP48668 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
KRT6CP48668 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms