Protein–RNA interactions for Protein: P40199

CEACAM6, Carcinoembryonic antigen-related cell adhesion molecule 6, humanhuman

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEACAM6P40199 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CEACAM6P40199 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CEACAM6P40199 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CEACAM6P40199 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CEACAM6P40199 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CEACAM6P40199 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CEACAM6P40199 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CEACAM6P40199 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CEACAM6P40199 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CEACAM6P40199 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CEACAM6P40199 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CEACAM6P40199 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CEACAM6P40199 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CEACAM6P40199 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CEACAM6P40199 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CEACAM6P40199 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CEACAM6P40199 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CEACAM6P40199 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CEACAM6P40199 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CEACAM6P40199 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CEACAM6P40199 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CEACAM6P40199 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CEACAM6P40199 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CEACAM6P40199 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CEACAM6P40199 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CEACAM6P40199 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CEACAM6P40199 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CEACAM6P40199 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CEACAM6P40199 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CEACAM6P40199 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CEACAM6P40199 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CEACAM6P40199 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CEACAM6P40199 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CEACAM6P40199 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CEACAM6P40199 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CEACAM6P40199 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CEACAM6P40199 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CEACAM6P40199 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CEACAM6P40199 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CEACAM6P40199 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CEACAM6P40199 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CEACAM6P40199 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CEACAM6P40199 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CEACAM6P40199 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CEACAM6P40199 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CEACAM6P40199 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CEACAM6P40199 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CEACAM6P40199 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CEACAM6P40199 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CEACAM6P40199 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CEACAM6P40199 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CEACAM6P40199 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CEACAM6P40199 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CEACAM6P40199 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CEACAM6P40199 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CEACAM6P40199 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CEACAM6P40199 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CEACAM6P40199 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CEACAM6P40199 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CEACAM6P40199 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CEACAM6P40199 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CEACAM6P40199 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CEACAM6P40199 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CEACAM6P40199 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CEACAM6P40199 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CEACAM6P40199 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CEACAM6P40199 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CEACAM6P40199 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CEACAM6P40199 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CEACAM6P40199 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CEACAM6P40199 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CEACAM6P40199 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CEACAM6P40199 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CEACAM6P40199 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CEACAM6P40199 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CEACAM6P40199 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CEACAM6P40199 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CEACAM6P40199 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CEACAM6P40199 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CEACAM6P40199 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CEACAM6P40199 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CEACAM6P40199 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CEACAM6P40199 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CEACAM6P40199 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CEACAM6P40199 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CEACAM6P40199 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CEACAM6P40199 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CEACAM6P40199 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CEACAM6P40199 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CEACAM6P40199 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CEACAM6P40199 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CEACAM6P40199 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CEACAM6P40199 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CEACAM6P40199 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CEACAM6P40199 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CEACAM6P40199 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CEACAM6P40199 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CEACAM6P40199 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CEACAM6P40199 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CEACAM6P40199 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.2 ms