Protein–RNA interactions for Protein: P40121

CAPG, Macrophage-capping protein, humanhuman

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPGP40121 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CAPGP40121 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CAPGP40121 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CAPGP40121 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CAPGP40121 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CAPGP40121 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CAPGP40121 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CAPGP40121 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CAPGP40121 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CAPGP40121 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CAPGP40121 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CAPGP40121 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CAPGP40121 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CAPGP40121 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CAPGP40121 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CAPGP40121 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CAPGP40121 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
CAPGP40121 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CAPGP40121 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CAPGP40121 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CAPGP40121 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CAPGP40121 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CAPGP40121 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CAPGP40121 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CAPGP40121 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CAPGP40121 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CAPGP40121 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CAPGP40121 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CAPGP40121 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
CAPGP40121 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CAPGP40121 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CAPGP40121 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CAPGP40121 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CAPGP40121 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CAPGP40121 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CAPGP40121 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CAPGP40121 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CAPGP40121 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CAPGP40121 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CAPGP40121 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CAPGP40121 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CAPGP40121 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CAPGP40121 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CAPGP40121 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CAPGP40121 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CAPGP40121 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CAPGP40121 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CAPGP40121 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CAPGP40121 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CAPGP40121 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CAPGP40121 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CAPGP40121 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CAPGP40121 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CAPGP40121 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CAPGP40121 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CAPGP40121 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CAPGP40121 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CAPGP40121 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CAPGP40121 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CAPGP40121 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CAPGP40121 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CAPGP40121 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CAPGP40121 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CAPGP40121 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CAPGP40121 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CAPGP40121 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CAPGP40121 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CAPGP40121 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CAPGP40121 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CAPGP40121 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CAPGP40121 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CAPGP40121 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CAPGP40121 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CAPGP40121 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CAPGP40121 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
CAPGP40121 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CAPGP40121 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CAPGP40121 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CAPGP40121 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CAPGP40121 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CAPGP40121 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CAPGP40121 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CAPGP40121 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CAPGP40121 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
CAPGP40121 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC17.21■□□□□ 0.34
CAPGP40121 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
CAPGP40121 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
CAPGP40121 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
CAPGP40121 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
CAPGP40121 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
CAPGP40121 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
CAPGP40121 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
CAPGP40121 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
CAPGP40121 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CAPGP40121 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CAPGP40121 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CAPGP40121 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CAPGP40121 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CAPGP40121 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CAPGP40121 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.9 ms