Protein–RNA interactions for Protein: P23443

RPS6KB1, Ribosomal protein S6 kinase beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 525 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS6KB1P23443 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RPS6KB1P23443 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RPS6KB1P23443 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RPS6KB1P23443 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RPS6KB1P23443 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RPS6KB1P23443 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RPS6KB1P23443 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RPS6KB1P23443 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RPS6KB1P23443 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RPS6KB1P23443 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RPS6KB1P23443 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RPS6KB1P23443 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RPS6KB1P23443 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RPS6KB1P23443 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RPS6KB1P23443 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RPS6KB1P23443 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RPS6KB1P23443 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RPS6KB1P23443 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RPS6KB1P23443 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RPS6KB1P23443 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RPS6KB1P23443 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RPS6KB1P23443 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RPS6KB1P23443 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RPS6KB1P23443 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
RPS6KB1P23443 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RPS6KB1P23443 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RPS6KB1P23443 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RPS6KB1P23443 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
RPS6KB1P23443 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RPS6KB1P23443 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RPS6KB1P23443 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RPS6KB1P23443 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RPS6KB1P23443 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RPS6KB1P23443 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RPS6KB1P23443 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RPS6KB1P23443 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RPS6KB1P23443 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RPS6KB1P23443 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RPS6KB1P23443 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RPS6KB1P23443 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RPS6KB1P23443 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RPS6KB1P23443 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RPS6KB1P23443 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RPS6KB1P23443 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RPS6KB1P23443 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RPS6KB1P23443 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RPS6KB1P23443 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RPS6KB1P23443 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RPS6KB1P23443 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RPS6KB1P23443 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RPS6KB1P23443 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RPS6KB1P23443 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
RPS6KB1P23443 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RPS6KB1P23443 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RPS6KB1P23443 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RPS6KB1P23443 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RPS6KB1P23443 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RPS6KB1P23443 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RPS6KB1P23443 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RPS6KB1P23443 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RPS6KB1P23443 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RPS6KB1P23443 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
RPS6KB1P23443 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
RPS6KB1P23443 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RPS6KB1P23443 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RPS6KB1P23443 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RPS6KB1P23443 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RPS6KB1P23443 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RPS6KB1P23443 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RPS6KB1P23443 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RPS6KB1P23443 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RPS6KB1P23443 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RPS6KB1P23443 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RPS6KB1P23443 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RPS6KB1P23443 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RPS6KB1P23443 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RPS6KB1P23443 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RPS6KB1P23443 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RPS6KB1P23443 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RPS6KB1P23443 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RPS6KB1P23443 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RPS6KB1P23443 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RPS6KB1P23443 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RPS6KB1P23443 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RPS6KB1P23443 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RPS6KB1P23443 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RPS6KB1P23443 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RPS6KB1P23443 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RPS6KB1P23443 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RPS6KB1P23443 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RPS6KB1P23443 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RPS6KB1P23443 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RPS6KB1P23443 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RPS6KB1P23443 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RPS6KB1P23443 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RPS6KB1P23443 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RPS6KB1P23443 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RPS6KB1P23443 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
RPS6KB1P23443 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RPS6KB1P23443 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms