Protein–RNA interactions for Protein: P20020

ATP2B1, Plasma membrane calcium-transporting ATPase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2B1P20020 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ATP2B1P20020 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
ATP2B1P20020 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ATP2B1P20020 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ATP2B1P20020 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ATP2B1P20020 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ATP2B1P20020 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ATP2B1P20020 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ATP2B1P20020 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ATP2B1P20020 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ATP2B1P20020 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ATP2B1P20020 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ATP2B1P20020 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ATP2B1P20020 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ATP2B1P20020 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ATP2B1P20020 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ATP2B1P20020 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
ATP2B1P20020 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ATP2B1P20020 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ATP2B1P20020 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ATP2B1P20020 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ATP2B1P20020 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ATP2B1P20020 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
ATP2B1P20020 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ATP2B1P20020 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ATP2B1P20020 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ATP2B1P20020 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ATP2B1P20020 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ATP2B1P20020 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ATP2B1P20020 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ATP2B1P20020 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ATP2B1P20020 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ATP2B1P20020 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ATP2B1P20020 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ATP2B1P20020 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
ATP2B1P20020 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ATP2B1P20020 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ATP2B1P20020 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ATP2B1P20020 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ATP2B1P20020 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ATP2B1P20020 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ATP2B1P20020 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ATP2B1P20020 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ATP2B1P20020 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ATP2B1P20020 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ATP2B1P20020 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ATP2B1P20020 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ATP2B1P20020 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ATP2B1P20020 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
ATP2B1P20020 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
ATP2B1P20020 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ATP2B1P20020 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ATP2B1P20020 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
ATP2B1P20020 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ATP2B1P20020 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ATP2B1P20020 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ATP2B1P20020 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ATP2B1P20020 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ATP2B1P20020 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
ATP2B1P20020 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ATP2B1P20020 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATP2B1P20020 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATP2B1P20020 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATP2B1P20020 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATP2B1P20020 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATP2B1P20020 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATP2B1P20020 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATP2B1P20020 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATP2B1P20020 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATP2B1P20020 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATP2B1P20020 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
ATP2B1P20020 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATP2B1P20020 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATP2B1P20020 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATP2B1P20020 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATP2B1P20020 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATP2B1P20020 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATP2B1P20020 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATP2B1P20020 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATP2B1P20020 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATP2B1P20020 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATP2B1P20020 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATP2B1P20020 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATP2B1P20020 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATP2B1P20020 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATP2B1P20020 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATP2B1P20020 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATP2B1P20020 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATP2B1P20020 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATP2B1P20020 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATP2B1P20020 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
ATP2B1P20020 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.03
ATP2B1P20020 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
ATP2B1P20020 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
ATP2B1P20020 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
ATP2B1P20020 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
ATP2B1P20020 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATP2B1P20020 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATP2B1P20020 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATP2B1P20020 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms