Protein–RNA interactions for Protein: P09110

ACAA1, 3-ketoacyl-CoA thiolase, peroxisomal, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACAA1P09110 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ACAA1P09110 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ACAA1P09110 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ACAA1P09110 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ACAA1P09110 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ACAA1P09110 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ACAA1P09110 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ACAA1P09110 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ACAA1P09110 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ACAA1P09110 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ACAA1P09110 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ACAA1P09110 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ACAA1P09110 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ACAA1P09110 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ACAA1P09110 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ACAA1P09110 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ACAA1P09110 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ACAA1P09110 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ACAA1P09110 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ACAA1P09110 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ACAA1P09110 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ACAA1P09110 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ACAA1P09110 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ACAA1P09110 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ACAA1P09110 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ACAA1P09110 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ACAA1P09110 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
ACAA1P09110 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
ACAA1P09110 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ACAA1P09110 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
ACAA1P09110 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ACAA1P09110 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
ACAA1P09110 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ACAA1P09110 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ACAA1P09110 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
ACAA1P09110 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ACAA1P09110 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ACAA1P09110 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ACAA1P09110 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ACAA1P09110 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ACAA1P09110 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ACAA1P09110 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ACAA1P09110 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ACAA1P09110 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ACAA1P09110 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ACAA1P09110 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ACAA1P09110 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ACAA1P09110 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ACAA1P09110 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ACAA1P09110 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ACAA1P09110 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ACAA1P09110 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ACAA1P09110 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ACAA1P09110 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ACAA1P09110 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ACAA1P09110 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ACAA1P09110 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ACAA1P09110 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ACAA1P09110 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
ACAA1P09110 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ACAA1P09110 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ACAA1P09110 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ACAA1P09110 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ACAA1P09110 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ACAA1P09110 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ACAA1P09110 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ACAA1P09110 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ACAA1P09110 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ACAA1P09110 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ACAA1P09110 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
ACAA1P09110 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ACAA1P09110 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ACAA1P09110 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
ACAA1P09110 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ACAA1P09110 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ACAA1P09110 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ACAA1P09110 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ACAA1P09110 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ACAA1P09110 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ACAA1P09110 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ACAA1P09110 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ACAA1P09110 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ACAA1P09110 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ACAA1P09110 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ACAA1P09110 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ACAA1P09110 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
ACAA1P09110 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ACAA1P09110 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ACAA1P09110 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ACAA1P09110 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ACAA1P09110 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ACAA1P09110 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ACAA1P09110 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ACAA1P09110 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ACAA1P09110 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ACAA1P09110 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ACAA1P09110 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ACAA1P09110 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ACAA1P09110 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ACAA1P09110 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms