Protein–RNA interactions for Protein: O43186

CRX, Cone-rod homeobox protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 299 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRXO43186 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
CRXO43186 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC14.27□□□□□ -0.12
CRXO43186 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
CRXO43186 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
CRXO43186 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
CRXO43186 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
CRXO43186 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
CRXO43186 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
CRXO43186 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC14.27□□□□□ -0.13
CRXO43186 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
CRXO43186 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
CRXO43186 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC14.27□□□□□ -0.13
CRXO43186 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
CRXO43186 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
CRXO43186 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC14.27□□□□□ -0.13
CRXO43186 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
CRXO43186 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
CRXO43186 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
CRXO43186 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
CRXO43186 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
CRXO43186 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
CRXO43186 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
CRXO43186 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
CRXO43186 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
CRXO43186 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
CRXO43186 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
CRXO43186 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
CRXO43186 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
CRXO43186 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
CRXO43186 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
CRXO43186 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
CRXO43186 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
CRXO43186 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
CRXO43186 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
CRXO43186 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
CRXO43186 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
CRXO43186 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
CRXO43186 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
CRXO43186 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
CRXO43186 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
CRXO43186 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
CRXO43186 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
CRXO43186 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
CRXO43186 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
CRXO43186 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
CRXO43186 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
CRXO43186 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
CRXO43186 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
CRXO43186 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
CRXO43186 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
CRXO43186 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
CRXO43186 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
CRXO43186 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
CRXO43186 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
CRXO43186 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
CRXO43186 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
CRXO43186 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
CRXO43186 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
CRXO43186 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
CRXO43186 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
CRXO43186 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
CRXO43186 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
CRXO43186 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
CRXO43186 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
CRXO43186 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
CRXO43186 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
CRXO43186 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
CRXO43186 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
CRXO43186 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
CRXO43186 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
CRXO43186 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
CRXO43186 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
CRXO43186 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
CRXO43186 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
CRXO43186 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
CRXO43186 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
CRXO43186 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
CRXO43186 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
CRXO43186 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
CRXO43186 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
CRXO43186 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
CRXO43186 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
CRXO43186 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
CRXO43186 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
CRXO43186 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
CRXO43186 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
CRXO43186 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
CRXO43186 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
CRXO43186 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
CRXO43186 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
CRXO43186 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
CRXO43186 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
CRXO43186 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
CRXO43186 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
CRXO43186 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
CRXO43186 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
CRXO43186 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
CRXO43186 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
CRXO43186 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC14.25□□□□□ -0.13
CRXO43186 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
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