Protein–RNA interactions for Protein: O43147

SGSM2, Small G protein signaling modulator 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,006 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGSM2O43147 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SGSM2O43147 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SGSM2O43147 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SGSM2O43147 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SGSM2O43147 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SGSM2O43147 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SGSM2O43147 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SGSM2O43147 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
SGSM2O43147 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
SGSM2O43147 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SGSM2O43147 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SGSM2O43147 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SGSM2O43147 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
SGSM2O43147 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SGSM2O43147 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SGSM2O43147 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SGSM2O43147 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SGSM2O43147 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SGSM2O43147 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SGSM2O43147 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SGSM2O43147 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SGSM2O43147 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SGSM2O43147 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SGSM2O43147 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SGSM2O43147 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SGSM2O43147 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SGSM2O43147 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SGSM2O43147 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SGSM2O43147 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SGSM2O43147 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SGSM2O43147 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SGSM2O43147 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
SGSM2O43147 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SGSM2O43147 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SGSM2O43147 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SGSM2O43147 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SGSM2O43147 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SGSM2O43147 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SGSM2O43147 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SGSM2O43147 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SGSM2O43147 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SGSM2O43147 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SGSM2O43147 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SGSM2O43147 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SGSM2O43147 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
SGSM2O43147 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SGSM2O43147 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SGSM2O43147 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SGSM2O43147 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
SGSM2O43147 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SGSM2O43147 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
SGSM2O43147 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SGSM2O43147 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SGSM2O43147 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SGSM2O43147 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SGSM2O43147 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SGSM2O43147 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SGSM2O43147 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SGSM2O43147 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SGSM2O43147 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SGSM2O43147 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SGSM2O43147 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SGSM2O43147 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SGSM2O43147 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SGSM2O43147 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SGSM2O43147 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
SGSM2O43147 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SGSM2O43147 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SGSM2O43147 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SGSM2O43147 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SGSM2O43147 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SGSM2O43147 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SGSM2O43147 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SGSM2O43147 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SGSM2O43147 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SGSM2O43147 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SGSM2O43147 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SGSM2O43147 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SGSM2O43147 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
SGSM2O43147 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SGSM2O43147 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SGSM2O43147 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SGSM2O43147 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
SGSM2O43147 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SGSM2O43147 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
SGSM2O43147 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SGSM2O43147 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SGSM2O43147 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
SGSM2O43147 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SGSM2O43147 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SGSM2O43147 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SGSM2O43147 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SGSM2O43147 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SGSM2O43147 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SGSM2O43147 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SGSM2O43147 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SGSM2O43147 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SGSM2O43147 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SGSM2O43147 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SGSM2O43147 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms