Protein–RNA interactions for Protein: O00559

EBAG9, Receptor-binding cancer antigen expressed on SiSo cells, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EBAG9O00559 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
EBAG9O00559 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
EBAG9O00559 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
EBAG9O00559 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
EBAG9O00559 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
EBAG9O00559 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
EBAG9O00559 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
EBAG9O00559 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
EBAG9O00559 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
EBAG9O00559 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
EBAG9O00559 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
EBAG9O00559 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
EBAG9O00559 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
EBAG9O00559 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
EBAG9O00559 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
EBAG9O00559 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
EBAG9O00559 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
EBAG9O00559 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
EBAG9O00559 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
EBAG9O00559 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
EBAG9O00559 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
EBAG9O00559 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
EBAG9O00559 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
EBAG9O00559 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
EBAG9O00559 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
EBAG9O00559 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
EBAG9O00559 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
EBAG9O00559 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC18.67■□□□□ 0.58
EBAG9O00559 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
EBAG9O00559 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
EBAG9O00559 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
EBAG9O00559 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
EBAG9O00559 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
EBAG9O00559 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
EBAG9O00559 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
EBAG9O00559 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
EBAG9O00559 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
EBAG9O00559 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
EBAG9O00559 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
EBAG9O00559 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
EBAG9O00559 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
EBAG9O00559 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
EBAG9O00559 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
EBAG9O00559 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
EBAG9O00559 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
EBAG9O00559 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
EBAG9O00559 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
EBAG9O00559 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
EBAG9O00559 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
EBAG9O00559 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
EBAG9O00559 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
EBAG9O00559 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
EBAG9O00559 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
EBAG9O00559 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
EBAG9O00559 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
EBAG9O00559 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
EBAG9O00559 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
EBAG9O00559 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
EBAG9O00559 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
EBAG9O00559 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
EBAG9O00559 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
EBAG9O00559 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
EBAG9O00559 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
EBAG9O00559 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
EBAG9O00559 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
EBAG9O00559 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
EBAG9O00559 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
EBAG9O00559 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
EBAG9O00559 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
EBAG9O00559 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
EBAG9O00559 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
EBAG9O00559 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
EBAG9O00559 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
EBAG9O00559 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
EBAG9O00559 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
EBAG9O00559 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
EBAG9O00559 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
EBAG9O00559 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
EBAG9O00559 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
EBAG9O00559 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
EBAG9O00559 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
EBAG9O00559 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
EBAG9O00559 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
EBAG9O00559 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
EBAG9O00559 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
EBAG9O00559 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
EBAG9O00559 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
EBAG9O00559 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
EBAG9O00559 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
EBAG9O00559 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
EBAG9O00559 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
EBAG9O00559 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
EBAG9O00559 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
EBAG9O00559 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
EBAG9O00559 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
EBAG9O00559 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
EBAG9O00559 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
EBAG9O00559 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
EBAG9O00559 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
EBAG9O00559 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.5 ms