Protein–RNA interactions for Protein: A6NKT7

RGPD3, RanBP2-like and GRIP domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,758 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGPD3A6NKT7 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RGPD3A6NKT7 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RGPD3A6NKT7 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RGPD3A6NKT7 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RGPD3A6NKT7 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RGPD3A6NKT7 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RGPD3A6NKT7 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RGPD3A6NKT7 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RGPD3A6NKT7 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RGPD3A6NKT7 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RGPD3A6NKT7 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RGPD3A6NKT7 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RGPD3A6NKT7 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RGPD3A6NKT7 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RGPD3A6NKT7 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RGPD3A6NKT7 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RGPD3A6NKT7 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
RGPD3A6NKT7 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RGPD3A6NKT7 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RGPD3A6NKT7 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RGPD3A6NKT7 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RGPD3A6NKT7 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RGPD3A6NKT7 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RGPD3A6NKT7 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RGPD3A6NKT7 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RGPD3A6NKT7 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RGPD3A6NKT7 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RGPD3A6NKT7 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RGPD3A6NKT7 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RGPD3A6NKT7 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RGPD3A6NKT7 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RGPD3A6NKT7 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RGPD3A6NKT7 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RGPD3A6NKT7 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
RGPD3A6NKT7 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RGPD3A6NKT7 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RGPD3A6NKT7 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
RGPD3A6NKT7 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RGPD3A6NKT7 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RGPD3A6NKT7 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RGPD3A6NKT7 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RGPD3A6NKT7 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
RGPD3A6NKT7 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RGPD3A6NKT7 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
RGPD3A6NKT7 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RGPD3A6NKT7 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RGPD3A6NKT7 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
RGPD3A6NKT7 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
RGPD3A6NKT7 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC23.58■■□□□ 1.37
RGPD3A6NKT7 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
RGPD3A6NKT7 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC23.58■■□□□ 1.37
RGPD3A6NKT7 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RGPD3A6NKT7 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RGPD3A6NKT7 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RGPD3A6NKT7 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RGPD3A6NKT7 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
RGPD3A6NKT7 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
RGPD3A6NKT7 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
RGPD3A6NKT7 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
RGPD3A6NKT7 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RGPD3A6NKT7 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
RGPD3A6NKT7 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RGPD3A6NKT7 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RGPD3A6NKT7 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RGPD3A6NKT7 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RGPD3A6NKT7 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RGPD3A6NKT7 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RGPD3A6NKT7 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RGPD3A6NKT7 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RGPD3A6NKT7 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RGPD3A6NKT7 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
RGPD3A6NKT7 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RGPD3A6NKT7 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
RGPD3A6NKT7 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
RGPD3A6NKT7 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RGPD3A6NKT7 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
RGPD3A6NKT7 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RGPD3A6NKT7 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RGPD3A6NKT7 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
RGPD3A6NKT7 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RGPD3A6NKT7 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RGPD3A6NKT7 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RGPD3A6NKT7 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RGPD3A6NKT7 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RGPD3A6NKT7 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RGPD3A6NKT7 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RGPD3A6NKT7 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RGPD3A6NKT7 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RGPD3A6NKT7 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RGPD3A6NKT7 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RGPD3A6NKT7 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RGPD3A6NKT7 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
RGPD3A6NKT7 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RGPD3A6NKT7 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RGPD3A6NKT7 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RGPD3A6NKT7 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RGPD3A6NKT7 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RGPD3A6NKT7 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RGPD3A6NKT7 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
RGPD3A6NKT7 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms