Protein–RNA interactions for Protein: A5D8V6

VPS37C, Vacuolar protein sorting-associated protein 37C, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS37CA5D8V6 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
VPS37CA5D8V6 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
VPS37CA5D8V6 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
VPS37CA5D8V6 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
VPS37CA5D8V6 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC21.79■■□□□ 1.08
VPS37CA5D8V6 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
VPS37CA5D8V6 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
VPS37CA5D8V6 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
VPS37CA5D8V6 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
VPS37CA5D8V6 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
VPS37CA5D8V6 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
VPS37CA5D8V6 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
VPS37CA5D8V6 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
VPS37CA5D8V6 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
VPS37CA5D8V6 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
VPS37CA5D8V6 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
VPS37CA5D8V6 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
VPS37CA5D8V6 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
VPS37CA5D8V6 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
VPS37CA5D8V6 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
VPS37CA5D8V6 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
VPS37CA5D8V6 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
VPS37CA5D8V6 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
VPS37CA5D8V6 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
VPS37CA5D8V6 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
VPS37CA5D8V6 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
VPS37CA5D8V6 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
VPS37CA5D8V6 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
VPS37CA5D8V6 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
VPS37CA5D8V6 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
VPS37CA5D8V6 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
VPS37CA5D8V6 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
VPS37CA5D8V6 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
VPS37CA5D8V6 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
VPS37CA5D8V6 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
VPS37CA5D8V6 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
VPS37CA5D8V6 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
VPS37CA5D8V6 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
VPS37CA5D8V6 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
VPS37CA5D8V6 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
VPS37CA5D8V6 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
VPS37CA5D8V6 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
VPS37CA5D8V6 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
VPS37CA5D8V6 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
VPS37CA5D8V6 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
VPS37CA5D8V6 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
VPS37CA5D8V6 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
VPS37CA5D8V6 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
VPS37CA5D8V6 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
VPS37CA5D8V6 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
VPS37CA5D8V6 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
VPS37CA5D8V6 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
VPS37CA5D8V6 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
VPS37CA5D8V6 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
VPS37CA5D8V6 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
VPS37CA5D8V6 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
VPS37CA5D8V6 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
VPS37CA5D8V6 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
VPS37CA5D8V6 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC21.77■■□□□ 1.08
VPS37CA5D8V6 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
VPS37CA5D8V6 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
VPS37CA5D8V6 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
VPS37CA5D8V6 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
VPS37CA5D8V6 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
VPS37CA5D8V6 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
VPS37CA5D8V6 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
VPS37CA5D8V6 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
VPS37CA5D8V6 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
VPS37CA5D8V6 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
VPS37CA5D8V6 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
VPS37CA5D8V6 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
VPS37CA5D8V6 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
VPS37CA5D8V6 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
VPS37CA5D8V6 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
VPS37CA5D8V6 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
VPS37CA5D8V6 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
VPS37CA5D8V6 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
VPS37CA5D8V6 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
VPS37CA5D8V6 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
VPS37CA5D8V6 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
VPS37CA5D8V6 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
VPS37CA5D8V6 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
VPS37CA5D8V6 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
VPS37CA5D8V6 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
VPS37CA5D8V6 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC21.76■■□□□ 1.07
VPS37CA5D8V6 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
VPS37CA5D8V6 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
VPS37CA5D8V6 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
VPS37CA5D8V6 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
VPS37CA5D8V6 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
VPS37CA5D8V6 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
VPS37CA5D8V6 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
VPS37CA5D8V6 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
VPS37CA5D8V6 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
VPS37CA5D8V6 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
VPS37CA5D8V6 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
VPS37CA5D8V6 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
VPS37CA5D8V6 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
VPS37CA5D8V6 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
VPS37CA5D8V6 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms